More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_3583 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  100 
 
 
171 aa  346  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  100 
 
 
171 aa  346  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  100 
 
 
171 aa  346  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  100 
 
 
171 aa  346  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  99.42 
 
 
171 aa  343  6e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3601  16S rRNA-processing protein RimM  99.42 
 
 
171 aa  343  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000401419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3941  16S rRNA-processing protein RimM  91.81 
 
 
171 aa  324  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000195727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1302  16S rRNA-processing protein RimM  91.23 
 
 
171 aa  322  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000535622  unclonable  1.06066e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3665  16S rRNA-processing protein RimM  90.06 
 
 
171 aa  315  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000001599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  87.72 
 
 
171 aa  313  8e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  71.35 
 
 
172 aa  262  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  67.84 
 
 
172 aa  253  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3855  16S rRNA processing protein RimM  99.06 
 
 
106 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.46605e-63 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1152  16S rRNA-processing protein RimM  55.36 
 
 
168 aa  195  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355761  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1355  16S rRNA-processing protein RimM  52.66 
 
 
172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000868178  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1384  16S rRNA-processing protein RimM  49.4 
 
 
172 aa  170  9e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00157124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1355  16S rRNA processing protein RimM  45.03 
 
 
177 aa  168  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000116768  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1659  16S rRNA-processing protein RimM  44.71 
 
 
171 aa  152  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1479  16S rRNA-processing protein RimM  44.64 
 
 
173 aa  143  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  46.39 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  46.39 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  45.18 
 
 
167 aa  137  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3856  16S rRNA processing protein RimM  96.97 
 
 
68 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.26975e-63 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0800  16S rRNA processing protein RimM  39.88 
 
 
166 aa  134  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0383963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  41.52 
 
 
173 aa  132  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  37.93 
 
 
169 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2406  16S rRNA-processing protein RimM  37.43 
 
 
169 aa  121  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000189149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1371  16S rRNA processing protein RimM  37.72 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000034435  normal  0.381877 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0659  16S rRNA processing protein RimM  37.8 
 
 
170 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110024  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0969  16S rRNA processing protein RimM  35.26 
 
 
176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000035902  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1710  16S rRNA-processing protein RimM  36.99 
 
 
167 aa  111  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000120991  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1413  16S rRNA processing protein RimM  35.71 
 
 
169 aa  111  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00447303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0767  16S rRNA-processing protein RimM  33.92 
 
 
174 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000495507  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1632  16S rRNA processing protein RimM  36.97 
 
 
179 aa  107  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  34.5 
 
 
169 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1494  16S rRNA processing protein RimM  33.73 
 
 
172 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0136988  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0130  16S rRNA-processing protein RimM  36.71 
 
 
177 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0512614  normal  0.0110832 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2144  16S rRNA processing protein RimM  33.92 
 
 
176 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3761  16S rRNA processing protein RimM  36.14 
 
 
173 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000217474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2869  16S rRNA processing protein RimM  36.42 
 
 
173 aa  101  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257467  hitchhiker  0.000000637329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2999  16S rRNA processing protein RimM  31.52 
 
 
176 aa  101  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000783686  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3041  16S rRNA processing protein RimM  31.52 
 
 
176 aa  101  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000787897  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2452  16S rRNA processing protein RimM  35.54 
 
 
176 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2189  16S rRNA-processing protein RimM  32.53 
 
 
172 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0264003  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3429  16S rRNA processing protein RimM  32.35 
 
 
172 aa  98.6  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000572848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  38.55 
 
 
170 aa  97.8  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3491  16S rRNA processing protein RimM  32.37 
 
 
172 aa  97.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.92497e-30 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3134  16S rRNA processing protein RimM  30.12 
 
 
167 aa  97.4  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.109744 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1415  16S rRNA processing protein RimM  36.42 
 
 
181 aa  97.1  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000206982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1514  16S rRNA-processing protein RimM  35.33 
 
 
187 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621384  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1199  16S rRNA processing protein RimM  35.12 
 
 
173 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000995465  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2885  16S rRNA processing protein RimM  30.59 
 
 
210 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0981  16S rRNA processing protein RimM  31.93 
 
 
171 aa  94.7  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal  0.277259 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0176  16S rRNA-processing protein RimM  30.46 
 
 
180 aa  94  9e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1224  16S rRNA processing protein RimM  31.48 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1231  16S rRNA processing protein RimM  31.48 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000213348  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  31.93 
 
 
170 aa  93.2  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4173  16S rRNA-processing protein RimM  30.12 
 
 
173 aa  92  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1967  16S rRNA-processing protein RimM  32.53 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0420461  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1400  16S rRNA processing protein RimM  31.14 
 
 
174 aa  92  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00457936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1947  16S rRNA-processing protein RimM  32.53 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2013  16S rRNA-processing protein RimM  32.53 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.325457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0645  16S rRNA processing protein RimM  33.73 
 
 
172 aa  91.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0229573  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1097  16S rRNA processing protein RimM  30.64 
 
 
176 aa  91.3  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.349347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0970  16S rRNA-processing protein RimM  32.56 
 
 
169 aa  90.9  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000015249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1619  16S rRNA processing protein RimM  30.41 
 
 
173 aa  90.9  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2183  16S rRNA processing protein RimM  33.14 
 
 
169 aa  90.9  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141383  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1803  16S rRNA processing protein RimM  32.91 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000356142  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26021  16S rRNA-processing protein RimM  30.41 
 
 
181 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17291  16S rRNA-processing protein RimM  32.16 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1307  16S rRNA-processing protein RimM  32.57 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  31.49 
 
 
233 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1964  16S rRNA-processing protein RimM  32.12 
 
 
165 aa  89  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07320  16S rRNA processing protein RimM  28.4 
 
 
170 aa  88.6  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238844  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2023  16S rRNA processing protein RimM  31.36 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00335336  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3421  16S rRNA processing protein RimM  33.13 
 
 
172 aa  87.8  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0959961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1682  16S rRNA-processing protein RimM  30.91 
 
 
165 aa  87.8  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00118486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1196  16S rRNA-processing protein RimM  32 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.934668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3257  16S rRNA processing protein RimM  29.76 
 
 
184 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11060  16S rRNA processing protein RimM  32.56 
 
 
182 aa  85.5  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0760298  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1664  16S rRNA processing protein RimM  31.93 
 
 
178 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0329621  hitchhiker  0.00376352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2581  16S rRNA processing protein RimM  32.54 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00383976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1829  16S rRNA processing protein RimM  30.12 
 
 
171 aa  84.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2481  16S rRNA-processing protein RimM  29.94 
 
 
197 aa  84  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00367621  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4006  16S rRNA processing protein RimM  32.75 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2259  16S rRNA-processing protein RimM  28.9 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.133781  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4970  16S rRNA processing protein RimM  29.71 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3580  16S rRNA-processing protein RimM  31.33 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0505  16S rRNA processing protein RimM  28.49 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20561  16S rRNA-processing protein RimM  29.07 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.656397  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2279  16S rRNA-processing protein RimM  31.93 
 
 
175 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0459452  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_505  16S rRNA processing protein RimM  30.77 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1289  16S rRNA processing protein RimM  26.67 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611954  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3758  16S rRNA processing protein RimM  32.53 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0504856  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0508  16S rRNA-processing protein RimM  31.25 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0566  16S rRNA processing protein RimM  29.59 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00173533  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1181  16S rRNA-processing protein RimM  29.07 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.612534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3400  16S rRNA-processing protein RimM  31.01 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.80773 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3592  16S rRNA-processing protein RimM  28.89 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0540  16S rRNA processing protein RimM  30.18 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000769846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>