132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43626 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43626  predicted protein  100 
 
 		 341 aa  693    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000259713  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  32.31 
 
 		 233 aa  85.9  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4970  16S rRNA processing protein RimM  32.84 
 
 		 180 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  32.49 
 
 		 186 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2259  16S rRNA-processing protein RimM  31.12 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.133781  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4078  16S rRNA-processing protein RimM  32.49 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0164  16S rRNA processing protein RimM  30.46 
 
 		 217 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1698  16S rRNA-processing protein RimM  30.26 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1386  16S rRNA-processing protein RimM  29.49 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4627  16S rRNA-processing protein RimM  27.14 
 
 		 208 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26021  16S rRNA-processing protein RimM  28.72 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17981  16S rRNA-processing protein RimM  29.74 
 
 		 179 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.581865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2221  16S rRNA-processing protein RimM  29.02 
 
 		 181 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000411195 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0176  16S rRNA-processing protein RimM  28.64 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18151  16S rRNA-processing protein RimM  28.21 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  28.5 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38467  predicted protein  32.06 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1420  16S rRNA-processing protein RimM  29.32 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.261134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17291  16S rRNA-processing protein RimM  27.18 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17931  16S rRNA-processing protein RimM  24.62 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1415  16S rRNA processing protein RimM  27.41 
 
 		 181 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000206982  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2189  16S rRNA-processing protein RimM  32.29 
 
 		 172 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0264003  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0934  16S rRNA-processing protein RimM  30.77 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0565923 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20561  16S rRNA-processing protein RimM  24.1 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.656397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2333  16S rRNA processing protein RimM  32.71 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377156  normal  0.0588442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  30.57 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  29.17 
 
 		 170 aa  55.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1181  16S rRNA-processing protein RimM  24.37 
 
 		 176 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.612534  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1559  16S rRNA processing protein RimM  28.87 
 
 		 176 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0559633 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1619  16S rRNA processing protein RimM  29.84 
 
 		 173 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2183  16S rRNA processing protein RimM  32.29 
 
 		 169 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3307  16S rRNA processing protein RimM  27.45 
 
 		 182 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4173  16S rRNA-processing protein RimM  27.08 
 
 		 173 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1967  16S rRNA-processing protein RimM  29.38 
 
 		 173 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0420461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2013  16S rRNA-processing protein RimM  29.38 
 
 		 173 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.325457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1947  16S rRNA-processing protein RimM  29.38 
 
 		 173 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1514  16S rRNA-processing protein RimM  30.41 
 
 		 187 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621384  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1885  16S rRNA-processing protein RimM  32.14 
 
 		 191 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1710  16S rRNA-processing protein RimM  27.04 
 
 		 167 aa  53.5  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000120991  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11060  16S rRNA processing protein RimM  30.65 
 
 		 182 aa  52.8  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0760298  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2897  16S rRNA processing protein RimM  26.49 
 
 		 185 aa  52.8  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1659  16S rRNA-processing protein RimM  23.32 
 
 		 171 aa  52.8  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  28.12 
 
 		 171 aa  52.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2702  16S rRNA-processing protein RimM  34.82 
 
 		 190 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.294971  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0130  16S rRNA-processing protein RimM  24.73 
 
 		 177 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0512614  normal  0.0110832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  28.72 
 
 		 201 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2481  16S rRNA-processing protein RimM  27.03 
 
 		 197 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00367621  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3354  16S rRNA-processing protein RimM  37.17 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12921  16S rRNA-processing protein RimM  27.84 
 
 		 176 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.368366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3665  16S rRNA-processing protein RimM  27.6 
 
 		 171 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000001599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0969  16S rRNA processing protein RimM  27.5 
 
 		 176 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000035902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1284  16S rRNA processing protein RimM  25.18 
 
 		 184 aa  51.2  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.304592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3941  16S rRNA-processing protein RimM  27.84 
 
 		 171 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000195727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1302  16S rRNA-processing protein RimM  27.84 
 
 		 171 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000535622  unclonable  1.06066e-25 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2539  16S rRNA-processing protein RimM  25.77 
 
 		 221 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1462  16S rRNA-processing protein RimM  27.32 
 
 		 202 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1196  16S rRNA-processing protein RimM  29 
 
 		 180 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.934668 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1097  16S rRNA processing protein RimM  25.25 
 
 		 176 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.349347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1829  16S rRNA processing protein RimM  27.23 
 
 		 171 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5924  16S rRNA processing protein RimM  27.46 
 
 		 172 aa  50.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.144619  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2886  16S rRNA-processing protein RimM  26.88 
 
 		 199 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0689866 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0946  16S rRNA-processing protein RimM  30 
 
 		 237 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3421  16S rRNA processing protein RimM  29.02 
 
 		 172 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0959961  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0591  16S rRNA-processing protein RimM  28.3 
 
 		 225 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  26.87 
 
 		 169 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  24 
 
 		 167 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1047  16S rRNA-processing protein RimM  30.53 
 
 		 169 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3940  16S rRNA-processing protein RimM  29.61 
 
 		 192 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.519471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1307  16S rRNA-processing protein RimM  28 
 
 		 180 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5344  16S rRNA-processing protein RimM  31.53 
 
 		 189 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0770  16S rRNA-processing protein RimM  32.71 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2674  16S rRNA processing protein RimM  24.87 
 
 		 169 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109453  hitchhiker  0.000000299021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0876  16S rRNA-processing protein RimM  27.67 
 
 		 184 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  25 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1413  16S rRNA processing protein RimM  27.6 
 
 		 169 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00447303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1029  16S rRNA-processing protein RimM  27.92 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0393  16S rRNA processing protein RimM  31.78 
 
 		 172 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4184  16S rRNA-processing protein RimM  27.34 
 
 		 225 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1070  16S rRNA-processing protein RimM  27.85 
 
 		 225 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0584634  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2708  16S rRNA-processing protein RimM  30 
 
 		 169 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0300271 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0518  16S rRNA processing protein RimM  25.18 
 
 		 188 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.541026  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  24.35 
 
 		 172 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  24.48 
 
 		 171 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  24.48 
 
 		 171 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  24.48 
 
 		 171 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3601  16S rRNA-processing protein RimM  25 
 
 		 171 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000401419  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0950  16S rRNA-processing protein RimM  29.23 
 
 		 225 aa  47.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  24.48 
 
 		 171 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2085  16S rRNA processing protein RimM  30.41 
 
 		 172 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1403  16S rRNA-processing protein RimM  28.49 
 
 		 187 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0805  16S rRNA-processing protein RimM  28.79 
 
 		 184 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2233  16S rRNA-processing protein RimM  30 
 
 		 223 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0749  16S rRNA-processing protein RimM  26.4 
 
 		 220 aa  46.2  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1479  16S rRNA-processing protein RimM  24.75 
 
 		 173 aa  46.2  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1691  16S rRNA-processing protein RimM  25.62 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1007  16S rRNA-processing protein RimM  29.91 
 
 		 244 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1169  16S rRNA processing protein RimM  29.51 
 
 		 181 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0970  16S rRNA-processing protein RimM  24.75 
 
 		 169 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000015249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2976  16S rRNA-processing protein RimM  29.91 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.470421  normal  0.0518366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1105  16S rRNA-processing protein RimM  26.8 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>