More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_0969 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_0969  16S rRNA processing protein RimM  100 
 
 
176 aa  347  6e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000035902  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0659  16S rRNA processing protein RimM  47.16 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1413  16S rRNA processing protein RimM  44.25 
 
 
169 aa  131  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00447303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  40.8 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1199  16S rRNA processing protein RimM  41.9 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000995465  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3758  16S rRNA processing protein RimM  46.15 
 
 
170 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0504856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0767  16S rRNA-processing protein RimM  39.31 
 
 
174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000495507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1494  16S rRNA processing protein RimM  41.71 
 
 
172 aa  124  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0136988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  36.42 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1152  16S rRNA-processing protein RimM  39.53 
 
 
168 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1355  16S rRNA processing protein RimM  41.01 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000116768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  42.35 
 
 
172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1710  16S rRNA-processing protein RimM  42.26 
 
 
167 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000120991  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1415  16S rRNA processing protein RimM  40.45 
 
 
181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000206982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1302  16S rRNA-processing protein RimM  36.42 
 
 
171 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000535622  unclonable  1.06066e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3601  16S rRNA-processing protein RimM  35.84 
 
 
171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000401419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3941  16S rRNA-processing protein RimM  37.36 
 
 
171 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000195727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1632  16S rRNA processing protein RimM  42.51 
 
 
179 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3665  16S rRNA-processing protein RimM  36.78 
 
 
171 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000001599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  35.26 
 
 
171 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  35.26 
 
 
171 aa  111  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  35.26 
 
 
171 aa  111  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  35.26 
 
 
171 aa  111  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  35.26 
 
 
171 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  38.82 
 
 
172 aa  111  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  40.34 
 
 
173 aa  111  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  36.99 
 
 
171 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2999  16S rRNA processing protein RimM  39.64 
 
 
176 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000783686  normal  0.831438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3041  16S rRNA processing protein RimM  39.64 
 
 
176 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000787897  normal  0.907916 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1371  16S rRNA processing protein RimM  39.2 
 
 
179 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000034435  normal  0.381877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1289  16S rRNA processing protein RimM  36.69 
 
 
182 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611954  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0566  16S rRNA processing protein RimM  36 
 
 
167 aa  104  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00173533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2406  16S rRNA-processing protein RimM  36.53 
 
 
169 aa  104  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000189149  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1301  16S rRNA processing protein RimM  34.68 
 
 
162 aa  103  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0244939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07320  16S rRNA processing protein RimM  35.8 
 
 
170 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238844  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_505  16S rRNA processing protein RimM  36.42 
 
 
166 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1664  16S rRNA processing protein RimM  36.69 
 
 
178 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0329621  hitchhiker  0.00376352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0970  16S rRNA-processing protein RimM  33.72 
 
 
169 aa  101  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000015249  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1355  16S rRNA-processing protein RimM  34.86 
 
 
172 aa  100  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000868178  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0540  16S rRNA processing protein RimM  36.42 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000769846  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1231  16S rRNA processing protein RimM  32.93 
 
 
176 aa  98.2  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000213348  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1224  16S rRNA processing protein RimM  32.93 
 
 
176 aa  98.2  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135812  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1803  16S rRNA processing protein RimM  32.92 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000356142  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1384  16S rRNA-processing protein RimM  36.21 
 
 
172 aa  95.9  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00157124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1535  16S rRNA processing protein RimM  34.19 
 
 
166 aa  95.5  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00265207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3491  16S rRNA processing protein RimM  34.48 
 
 
172 aa  94.4  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.92497e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3429  16S rRNA processing protein RimM  34.48 
 
 
172 aa  94  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000572848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09770  16S rRNA processing protein RimM  35.59 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.098871  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2259  16S rRNA-processing protein RimM  35.36 
 
 
182 aa  91.3  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.133781  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0800  16S rRNA processing protein RimM  32.14 
 
 
166 aa  91.3  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0383963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2307  16S rRNA processing protein RimM  36.42 
 
 
170 aa  90.9  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00013128  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2189  16S rRNA-processing protein RimM  34.5 
 
 
172 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0264003  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  34.29 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4078  16S rRNA-processing protein RimM  35.75 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0322  16S rRNA processing protein RimM  31.74 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00023377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3761  16S rRNA processing protein RimM  36.78 
 
 
173 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000217474  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1375  16S rRNA-processing protein RimM  36.14 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0645  16S rRNA processing protein RimM  39.18 
 
 
172 aa  88.2  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0229573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0648  16S rRNA processing protein RimM  29.65 
 
 
177 aa  88.2  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4619  16S rRNA processing protein RimM  33.33 
 
 
174 aa  87.8  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1659  16S rRNA-processing protein RimM  32.94 
 
 
171 aa  87.8  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  34.81 
 
 
186 aa  87.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1479  16S rRNA-processing protein RimM  33.53 
 
 
173 aa  87  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1298  16S rRNA-processing protein RimM  33.91 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000105261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  34.48 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1323  16S rRNA-processing protein RimM  33.91 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000721778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3421  16S rRNA processing protein RimM  35.96 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0959961  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4970  16S rRNA processing protein RimM  33.52 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1964  16S rRNA-processing protein RimM  36.14 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1682  16S rRNA-processing protein RimM  34.94 
 
 
165 aa  86.7  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00118486  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1559  16S rRNA processing protein RimM  35.06 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0559633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1514  16S rRNA-processing protein RimM  38.29 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621384  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2452  16S rRNA processing protein RimM  31.98 
 
 
176 aa  84.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000919836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2222  16S rRNA processing protein  36.26 
 
 
175 aa  84.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.646e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1947  16S rRNA-processing protein RimM  35.09 
 
 
173 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3400  16S rRNA-processing protein RimM  35.12 
 
 
178 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.80773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1967  16S rRNA-processing protein RimM  35.09 
 
 
173 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0420461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15980  16S rRNA-processing protein RimM  34.94 
 
 
175 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00452583  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2013  16S rRNA-processing protein RimM  35.09 
 
 
173 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.325457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1463  16S rRNA-processing protein RimM  34.52 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.278393  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4258  16S rRNA-processing protein RimM  34.52 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  33.15 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17291  16S rRNA-processing protein RimM  32.95 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0847  16S rRNA processing protein RimM  33.53 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3257  16S rRNA processing protein RimM  36.36 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  36.05 
 
 
170 aa  82  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0176  16S rRNA-processing protein RimM  30.29 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2481  16S rRNA-processing protein RimM  38.6 
 
 
197 aa  82  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00367621  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12921  16S rRNA-processing protein RimM  34.91 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.368366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1068  16S rRNA-processing protein RimM  34.52 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.185683  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1020  16S rRNA-processing protein RimM  35.12 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104306  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4156  16S rRNA-processing protein RimM  34.52 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12723  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2221  16S rRNA-processing protein RimM  34.68 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000411195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1474  16S rRNA processing protein RimM  34.91 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480485  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2859  16S rRNA-processing protein RimM  32.57 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1066  16S rRNA processing protein RimM  31.43 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000147404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3847  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00015023  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2892  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2760  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0552999  normal  0.0361654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02461  hypothetical protein  31.43 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00779193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>