More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1091 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1091  16S rRNA-processing protein RimM  100 
 
 
233 aa  464  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166922  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0164  16S rRNA processing protein RimM  64.64 
 
 
217 aa  251  7e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.199907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1386  16S rRNA-processing protein RimM  53.43 
 
 
207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4117  16S rRNA-processing protein RimM  56.52 
 
 
186 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4078  16S rRNA-processing protein RimM  55.98 
 
 
186 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2259  16S rRNA-processing protein RimM  60.67 
 
 
182 aa  206  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.133781  normal  0.174445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4970  16S rRNA processing protein RimM  57.46 
 
 
180 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4627  16S rRNA-processing protein RimM  50.49 
 
 
208 aa  192  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26021  16S rRNA-processing protein RimM  50.81 
 
 
181 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17291  16S rRNA-processing protein RimM  49.44 
 
 
176 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0176  16S rRNA-processing protein RimM  48.89 
 
 
180 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0130  16S rRNA-processing protein RimM  48.24 
 
 
177 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0512614  normal  0.0110832 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20561  16S rRNA-processing protein RimM  46.11 
 
 
176 aa  158  6e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.656397  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1181  16S rRNA-processing protein RimM  46.11 
 
 
176 aa  158  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.612534  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1698  16S rRNA-processing protein RimM  38.04 
 
 
179 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18151  16S rRNA-processing protein RimM  37.91 
 
 
179 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17931  16S rRNA-processing protein RimM  36.96 
 
 
179 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17981  16S rRNA-processing protein RimM  37.5 
 
 
179 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.581865  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38467  predicted protein  36.63 
 
 
235 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.375973 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1091  16S rRNA-processing protein RimM  34.81 
 
 
172 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000655231  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0981  16S rRNA processing protein RimM  38.67 
 
 
171 aa  97.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613857  normal  0.277259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2885  16S rRNA processing protein RimM  34.25 
 
 
210 aa  95.9  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0324  16S rRNA processing protein RimM  34.36 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.884603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2494  16S rRNA-processing protein RimM  32.6 
 
 
171 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000966692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1710  16S rRNA-processing protein RimM  30.39 
 
 
167 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000120991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3980  16S rRNA-processing protein RimM  31.49 
 
 
171 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000074804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3354  16S rRNA-processing protein RimM  34.9 
 
 
209 aa  89  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3884  16S rRNA-processing protein RimM  31.49 
 
 
171 aa  89  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000398495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3693  16S rRNA-processing protein RimM  31.49 
 
 
171 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000284682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3583  16S rRNA-processing protein RimM  31.49 
 
 
171 aa  89  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.00886e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3890  16S rRNA-processing protein RimM  31.49 
 
 
171 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000177338  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2702  16S rRNA-processing protein RimM  34.9 
 
 
190 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.294971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3601  16S rRNA-processing protein RimM  31.49 
 
 
171 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000401419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0664  16S rRNA-processing protein RimM  36.87 
 
 
170 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.377331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1984  16S rRNA-processing protein RimM  33.15 
 
 
172 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1029  16S rRNA processing protein RimM  34.43 
 
 
179 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.635977  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0805  16S rRNA-processing protein RimM  32.96 
 
 
167 aa  86.7  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000311839  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43626  predicted protein  32.31 
 
 
341 aa  86.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00000259713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1302  16S rRNA-processing protein RimM  29.83 
 
 
171 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000535622  unclonable  1.06066e-25 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0767  16S rRNA-processing protein RimM  28.65 
 
 
174 aa  85.9  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000495507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3941  16S rRNA-processing protein RimM  29.83 
 
 
171 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000195727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3665  16S rRNA-processing protein RimM  30.39 
 
 
171 aa  85.1  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000001599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0787  16S rRNA-processing protein RimM  30 
 
 
173 aa  85.1  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.0056e-16  unclonable  2.29437e-28 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2221  16S rRNA-processing protein RimM  34.97 
 
 
181 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000411195 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1355  16S rRNA processing protein RimM  34.08 
 
 
177 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000116768  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1415  16S rRNA processing protein RimM  31.89 
 
 
181 aa  84  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000206982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2481  16S rRNA-processing protein RimM  32.96 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00367621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0969  16S rRNA processing protein RimM  32.61 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000035902  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1829  16S rRNA processing protein RimM  36.16 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0875871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3421  16S rRNA processing protein RimM  35.56 
 
 
172 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0959961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1105  16S rRNA-processing protein RimM  32.07 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1885  16S rRNA-processing protein RimM  33.33 
 
 
191 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0110154  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09170  16S rRNA processing protein RimM  36.22 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2052  16S rRNA processing protein RimM  29.61 
 
 
169 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07320  16S rRNA processing protein RimM  29.83 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000238844  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1413  16S rRNA processing protein RimM  31.67 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00447303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1474  16S rRNA-processing protein RimM  31.84 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2144  16S rRNA processing protein RimM  31.11 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0950  16S rRNA-processing protein RimM  35.2 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0946  16S rRNA-processing protein RimM  30.8 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.501365  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1054  RimM protein for 16S rRNA processing  35 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0659  16S rRNA processing protein RimM  32.42 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0226  16S rRNA processing protein RimM  35.75 
 
 
170 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.652576  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1559  16S rRNA processing protein RimM  35.56 
 
 
176 aa  79  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0559633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0749  16S rRNA-processing protein RimM  31.73 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2674  16S rRNA processing protein RimM  30.73 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109453  hitchhiker  0.000000299021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1619  16S rRNA processing protein RimM  34.25 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2233  16S rRNA-processing protein RimM  32.96 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347388  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1097  16S rRNA processing protein RimM  29.41 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.349347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1514  16S rRNA-processing protein RimM  35.33 
 
 
187 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621384  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1691  16S rRNA-processing protein RimM  28.14 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0591  16S rRNA-processing protein RimM  33.16 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1070  16S rRNA-processing protein RimM  32.07 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0584634  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1632  16S rRNA processing protein RimM  33.33 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1224  16S rRNA processing protein RimM  30.59 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135812  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1029  16S rRNA-processing protein RimM  32.07 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1231  16S rRNA processing protein RimM  30.59 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000213348  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0770  16S rRNA-processing protein RimM  32.77 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2539  16S rRNA-processing protein RimM  29.03 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0712  16S rRNA-processing protein RimM  26.82 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000237491  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1199  16S rRNA processing protein RimM  29.38 
 
 
173 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000995465  normal  0.109334 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1462  16S rRNA-processing protein RimM  29.19 
 
 
202 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2874  16S rRNA processing protein RimM  31.55 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2609  16S rRNA-processing protein RimM  35.2 
 
 
171 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.740533  normal  0.0121185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0992  16S rRNA-processing protein RimM  32.45 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584349  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1186  16S rRNA processing protein RimM  33.51 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.292134  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2406  16S rRNA-processing protein RimM  26.11 
 
 
169 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000189149  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09770  16S rRNA processing protein RimM  33.7 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.098871  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1403  16S rRNA-processing protein RimM  30.46 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1659  16S rRNA-processing protein RimM  26.82 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1947  16S rRNA-processing protein RimM  36.56 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.638971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1967  16S rRNA-processing protein RimM  36.56 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0420461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2013  16S rRNA-processing protein RimM  36.56 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.325457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2976  16S rRNA-processing protein RimM  30 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.470421  normal  0.0518366 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0748  16S rRNA-processing protein RimM  36.97 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2189  16S rRNA-processing protein RimM  34.08 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0264003  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0344  16S rRNA-processing protein RimM  32.07 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1384  16S rRNA-processing protein RimM  27.68 
 
 
172 aa  72  0.000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00157124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4619  16S rRNA processing protein RimM  29.61 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1007  16S rRNA-processing protein RimM  31.43 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>