146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3108 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3108  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  490  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1313  TetR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 231 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 461 aa  105  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  37.84 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  24.88 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 218 aa  48.9  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 199 aa  48.5  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  44.78 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 232 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 217 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 280 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0337  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 212 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2624  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.184874  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2668  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.323955  normal  0.884032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2653  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  22.96 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  34.29 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  24.06 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>