More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2278 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  45.59 
 
 		 824 aa  721    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  42.31 
 
 		 816 aa  639    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  100 
 
 		 835 aa  1691    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  43.63 
 
 		 828 aa  709    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  43.82 
 
 		 872 aa  667    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  41.19 
 
 		 821 aa  640    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  48.08 
 
 		 825 aa  726    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  43.12 
 
 		 859 aa  629  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  42.77 
 
 		 815 aa  627  1e-178  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  39.62 
 
 		 813 aa  598  1e-169  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  38.88 
 
 		 821 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  38.49 
 
 		 823 aa  532  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  35.78 
 
 		 807 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  38.78 
 
 		 823 aa  531  1e-149  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  38.71 
 
 		 823 aa  528  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  34.16 
 
 		 800 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  25.81 
 
 		 755 aa  212  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  24.57 
 
 		 815 aa  204  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.55 
 
 		 807 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  22.36 
 
 		 778 aa  177  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  23.2 
 
 		 788 aa  170  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  22.11 
 
 		 905 aa  164  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.68 
 
 		 764 aa  163  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  24.57 
 
 		 808 aa  154  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  22.68 
 
 		 803 aa  152  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  22.34 
 
 		 804 aa  148  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.84 
 
 		 967 aa  146  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  25.13 
 
 		 1051 aa  142  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  24.25 
 
 		 806 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.56 
 
 		 811 aa  139  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  24.28 
 
 		 773 aa  138  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  25.73 
 
 		 756 aa  137  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.26 
 
 		 837 aa  135  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  25.07 
 
 		 860 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  23.43 
 
 		 788 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1083 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  26.75 
 
 		 751 aa  127  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  23.82 
 
 		 801 aa  125  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  23.58 
 
 		 877 aa  124  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  22.04 
 
 		 779 aa  122  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  25.08 
 
 		 763 aa  122  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  24.48 
 
 		 865 aa  122  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.29 
 
 		 762 aa  119  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.02 
 
 		 789 aa  117  8.999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22.36 
 
 		 831 aa  114  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  20.45 
 
 		 767 aa  113  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.2 
 
 		 800 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  21.62 
 
 		 694 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.66 
 
 		 764 aa  111  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.42 
 
 		 717 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  23.51 
 
 		 765 aa  106  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  23.06 
 
 		 778 aa  104  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  22.38 
 
 		 788 aa  104  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  22.34 
 
 		 789 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  21.25 
 
 		 779 aa  102  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  22.33 
 
 		 788 aa  101  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  22.99 
 
 		 789 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  21.88 
 
 		 785 aa  99  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  19.23 
 
 		 792 aa  97.8  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  24.05 
 
 		 694 aa  97.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  30.63 
 
 		 1204 aa  95.1  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  24.58 
 
 		 805 aa  93.2  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  30.48 
 
 		 895 aa  93.2  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  21.18 
 
 		 799 aa  92  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  21.2 
 
 		 797 aa  90.9  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.26 
 
 		 746 aa  91.3  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  26.88 
 
 		 879 aa  89.7  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  26.23 
 
 		 898 aa  89  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  24.4 
 
 		 385 aa  88.2  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  21.51 
 
 		 692 aa  87.4  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  26.25 
 
 		 842 aa  86.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  29.2 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  23.53 
 
 		 797 aa  84.7  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  23.45 
 
 		 881 aa  84.3  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  23.47 
 
 		 385 aa  84  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  22.96 
 
 		 869 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  27.38 
 
 		 855 aa  84  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  21.59 
 
 		 796 aa  84  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  22.87 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  29.88 
 
 		 862 aa  82.8  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  22.8 
 
 		 869 aa  82  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.69 
 
 		 747 aa  81.6  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.54 
 
 		 812 aa  81.6  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  30.05 
 
 		 776 aa  81.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  28.37 
 
 		 862 aa  80.9  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.75 
 
 		 861 aa  79.3  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  20.24 
 
 		 792 aa  79  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  23.44 
 
 		 755 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  25.38 
 
 		 832 aa  77  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  24.62 
 
 		 787 aa  77.4  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  32.02 
 
 		 923 aa  77.4  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  25.71 
 
 		 1011 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  28.1 
 
 		 1359 aa  76.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  20.51 
 
 		 752 aa  75.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.71 
 
 		 872 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  23.92 
 
 		 874 aa  75.9  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  24.23 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  25.64 
 
 		 758 aa  74.7  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  20.35 
 
 		 727 aa  74.3  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  27.49 
 
 		 1131 aa  73.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>