214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4944 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  793    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  39.89 
 
 		 1182 aa  252  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  40.06 
 
 		 1192 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3796  hypothetical protein  30.65 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  24.68 
 
 		 833 aa  69.7  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 946 aa  66.2  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  42.17 
 
 		 927 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  36.67 
 
 		 874 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  37.36 
 
 		 1147 aa  60.1  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 952 aa  59.7  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1307  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 779 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 893 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 778 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1003 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  40.3 
 
 		 828 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  39.36 
 
 		 855 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  47.37 
 
 		 1001 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  39.02 
 
 		 1087 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  42.47 
 
 		 1089 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  35.45 
 
 		 935 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  31.34 
 
 		 856 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10788  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  41.67 
 
 		 287 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.65649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 933 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1036 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  37.35 
 
 		 1038 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 777 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 902 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  28.48 
 
 		 808 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 753 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  32.54 
 
 		 1025 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 814 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  31.58 
 
 		 839 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  36.84 
 
 		 1013 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  28.33 
 
 		 805 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 1004 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 791 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 882 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1064 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 836 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 1152 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 		 828 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  28 
 
 		 848 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 991 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 922 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  30.19 
 
 		 792 aa  53.5  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  25.31 
 
 		 806 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  31.45 
 
 		 823 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  30.17 
 
 		 816 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2241  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  32.97 
 
 		 165 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176213  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 830 aa  52.8  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1082 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 793 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  30.93 
 
 		 797 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  35.19 
 
 		 719 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 1081 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 798 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  40.32 
 
 		 1014 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  43.21 
 
 		 1071 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 		 1016 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 730 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 775 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1020  hypothetical protein  30.7 
 
 		 936 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00854238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  30.71 
 
 		 1043 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  40.24 
 
 		 993 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  23.17 
 
 		 809 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 813 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 828 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1079 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 920 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  38.67 
 
 		 767 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  31.48 
 
 		 822 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  35 
 
 		 1075 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  29.66 
 
 		 853 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 817 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 854 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  35.78 
 
 		 814 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 833 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 919 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1087 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 971 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_002950  PG2226  hypothetical protein  32.48 
 
 		 740 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000689812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  34.17 
 
 		 1008 aa  50.4  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  32.38 
 
 		 986 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 845 aa  50.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  41.33 
 
 		 1062 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 994 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 888 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  38.27 
 
 		 1019 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 814 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  29.33 
 
 		 838 aa  50.1  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  32.53 
 
 		 1063 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  38.24 
 
 		 857 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 1050 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  34.44 
 
 		 807 aa  49.7  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 972 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  29.32 
 
 		 999 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 816 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  41.94 
 
 		 829 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 1023 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>