120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4667 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  100 
 
 		 275 aa  570  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  57.98 
 
 		 286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  51.95 
 
 		 313 aa  275  7e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  36.16 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  35.19 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.25 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  34.72 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 		 556 aa  139  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  34.83 
 
 		 641 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  34.83 
 
 		 642 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.74 
 
 		 252 aa  135  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  35.94 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  34.21 
 
 		 588 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  33.45 
 
 		 469 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  34.48 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  32.95 
 
 		 409 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.21 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.96 
 
 		 1290 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  35.45 
 
 		 1321 aa  123  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  32.03 
 
 		 389 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  34.35 
 
 		 383 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  32.55 
 
 		 503 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.34 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  33.82 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  34.63 
 
 		 426 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.53 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.94 
 
 		 532 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 		 627 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  34.44 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  29.67 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.91 
 
 		 358 aa  112  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  34.98 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  29.43 
 
 		 694 aa  109  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.94 
 
 		 633 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  32.2 
 
 		 883 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  29.69 
 
 		 1059 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  32.2 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.83 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  34.1 
 
 		 569 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  33.85 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  33.7 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 		 1332 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  28.75 
 
 		 328 aa  99.8  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  27.02 
 
 		 405 aa  99.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.64 
 
 		 884 aa  99.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.15 
 
 		 819 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.95 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  29.2 
 
 		 1441 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.34 
 
 		 547 aa  96.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  28.35 
 
 		 467 aa  95.9  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  31.03 
 
 		 423 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.91 
 
 		 742 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 394 aa  92.8  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.97 
 
 		 912 aa  92  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.12 
 
 		 1694 aa  90.1  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  24.14 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  30.26 
 
 		 384 aa  89.7  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 		 752 aa  89.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.69 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 		 449 aa  89  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  32.97 
 
 		 427 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  27.24 
 
 		 722 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  33.76 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  33.52 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  25.2 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  27.05 
 
 		 1918 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  30.11 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 		 465 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  26.51 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  31.58 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  29.67 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  28.78 
 
 		 1028 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  26.52 
 
 		 477 aa  73.2  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  27.68 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6178  glycoside hydrolase family 16  28.51 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.474136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  28.86 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  30.34 
 
 		 608 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  26.44 
 
 		 907 aa  69.7  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  28.1 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  26.62 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  27.27 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  27.62 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  30.91 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  25.38 
 
 		 1707 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  28.72 
 
 		 842 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 686 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  25.71 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  25.99 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0298  glycoside hydrolase family protein  25.2 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0144  glycoside hydrolase family 16  27.4 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.568109  normal  0.0389127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0446  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  28.08 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  30.54 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  29.25 
 
 		 470 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  25.45 
 
 		 691 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0416  twin-arginine translocation pathway signal  25.99 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0880  glycoside hydrolase family protein  25.37 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>