117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2716 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2716  PKD domain containing protein  100 
 
 
664 aa  1253    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575961  normal  0.0544825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3903  PKD domain containing protein  42.31 
 
 
644 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1399  PKD domain containing protein  35.78 
 
 
669 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0425  PKD domain containing protein  29.09 
 
 
660 aa  62  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115595  normal  0.0481656 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  23.55 
 
 
545 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  24.15 
 
 
6276 aa  57.8  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  40.7 
 
 
1667 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  42.5 
 
 
2000 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  53.19 
 
 
945 aa  53.5  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  42.11 
 
 
820 aa  53.5  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  46.38 
 
 
943 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  35.14 
 
 
951 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  43.82 
 
 
884 aa  52.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  37.89 
 
 
818 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  41.79 
 
 
948 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  38.32 
 
 
1667 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  36.61 
 
 
938 aa  52  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  33.33 
 
 
861 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2393  PKD domain containing protein  38.64 
 
 
600 aa  51.2  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.562625  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  40.4 
 
 
910 aa  51.6  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  38.1 
 
 
791 aa  51.2  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.74 
 
 
835 aa  51.2  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  35.65 
 
 
1463 aa  51.2  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  51.85 
 
 
1732 aa  51.2  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.03 
 
 
947 aa  50.8  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  37.97 
 
 
929 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 
948 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.74 
 
 
835 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.39 
 
 
1158 aa  50.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.79 
 
 
940 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.43 
 
 
699 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  48.53 
 
 
528 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  50.82 
 
 
2066 aa  49.7  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 
639 aa  49.7  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  37.74 
 
 
930 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  35.16 
 
 
1094 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 
948 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  35.29 
 
 
3197 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  34.95 
 
 
971 aa  48.5  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  37.93 
 
 
792 aa  48.1  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  46.3 
 
 
2554 aa  48.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  40.28 
 
 
2272 aa  47.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  40 
 
 
677 aa  47.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  35.19 
 
 
2036 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  44.64 
 
 
873 aa  47.8  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  36.46 
 
 
1565 aa  47.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  36.36 
 
 
935 aa  47.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  33.06 
 
 
1231 aa  47.4  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.14 
 
 
835 aa  47.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  40 
 
 
1057 aa  47.4  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  36.89 
 
 
615 aa  47.4  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  47.37 
 
 
941 aa  47.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  28.46 
 
 
960 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  28.46 
 
 
960 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.86 
 
 
713 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  36.99 
 
 
735 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  39.51 
 
 
685 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  32.86 
 
 
658 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  37.86 
 
 
679 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  28.46 
 
 
960 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  37.5 
 
 
936 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  37.5 
 
 
936 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  34 
 
 
719 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  42.7 
 
 
3295 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  37.04 
 
 
777 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  39.39 
 
 
1150 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  41.1 
 
 
675 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  36.11 
 
 
644 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.43 
 
 
2122 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  33.64 
 
 
551 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  28.71 
 
 
1862 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  37.97 
 
 
814 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.31 
 
 
944 aa  46.2  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  35.8 
 
 
967 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  43.94 
 
 
852 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  39.47 
 
 
3197 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  34 
 
 
958 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.56 
 
 
816 aa  45.8  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  36.49 
 
 
1300 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  27.4 
 
 
5453 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  33.78 
 
 
713 aa  45.8  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  41.46 
 
 
840 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  33.62 
 
 
1194 aa  45.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  36.49 
 
 
1842 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  37.84 
 
 
1882 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  36.67 
 
 
752 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  36.36 
 
 
1682 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.38 
 
 
942 aa  45.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  41.07 
 
 
948 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  38.1 
 
 
918 aa  45.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  37.8 
 
 
684 aa  45.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  38.55 
 
 
952 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  37 
 
 
871 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  36.76 
 
 
870 aa  45.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.79 
 
 
1620 aa  45.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  37.84 
 
 
669 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  39.19 
 
 
1531 aa  44.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  26.45 
 
 
1104 aa  44.7  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.1 
 
 
773 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  40.96 
 
 
1380 aa  45.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>