More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6878 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1078 aa  2189    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  34.77 
 
 		 1088 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1064 aa  547  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 1039 aa  539  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 1050 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.94 
 
 		 1040 aa  513  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  32 
 
 		 1047 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1011 aa  502  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  33.45 
 
 		 1081 aa  499  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  35.36 
 
 		 1059 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1071 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 1189 aa  489  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  32.94 
 
 		 1059 aa  486  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  32.23 
 
 		 1081 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  33.66 
 
 		 1059 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  32.81 
 
 		 1093 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1101 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  31.77 
 
 		 1044 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1063 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  31.41 
 
 		 1038 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 1166 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  32.54 
 
 		 1105 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 		 1068 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  31.91 
 
 		 1043 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 1051 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  32.17 
 
 		 1065 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  31.12 
 
 		 1176 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1065 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  31.43 
 
 		 1058 aa  441  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  32.01 
 
 		 1129 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 1153 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  31.7 
 
 		 1028 aa  436  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  32.11 
 
 		 1142 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1147 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 		 1137 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  30.89 
 
 		 1027 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  30.54 
 
 		 1074 aa  422  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 1031 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  30.53 
 
 		 1032 aa  409  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1071 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 1169 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 1033 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2721  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1072 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 		 1063 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 1038 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1135 aa  390  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  28.12 
 
 		 1071 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  31.55 
 
 		 1115 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 1138 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 1043 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  29.35 
 
 		 1010 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1138 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  31.06 
 
 		 1051 aa  379  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  30.27 
 
 		 1098 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 1098 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1073 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1081 aa  376  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1022 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 1163 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 1036 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 1234 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1033 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1073 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 1102 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 1041 aa  361  4e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1165 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1099 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 1186 aa  354  5e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  27.92 
 
 		 1025 aa  353  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1127 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  30.09 
 
 		 1067 aa  351  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1107 aa  350  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  28.79 
 
 		 1083 aa  345  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 		 1153 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0339  TonB-dependent receptor plug  28.41 
 
 		 1087 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.135408  decreased coverage  0.000558504 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  28.79 
 
 		 1088 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1008 aa  325  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1166  TonB-dependent receptor plug  27.58 
 
 		 1084 aa  323  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.689476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4505  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 1046 aa  317  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1057 aa  314  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1008 aa  301  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 1027 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 989 aa  299  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1040 aa  297  9e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 1038 aa  295  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 1023 aa  294  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1152 aa  291  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 1050 aa  288  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  27.5 
 
 		 1128 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1124 aa  283  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 		 1132 aa  282  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 999 aa  280  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 1029 aa  280  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1021 aa  279  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  26.75 
 
 		 1019 aa  278  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.04 
 
 		 1028 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1161 aa  277  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1116 aa  276  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1154 aa  274  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 1043 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>