244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6565 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 488 aa  1006    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  49.09 
 
 		 493 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1551  RagB/SusD domain protein  30.31 
 
 		 503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  29.69 
 
 		 456 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 469 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 479 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 472 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 503 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26.38 
 
 		 458 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 487 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 486 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  28.61 
 
 		 459 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 502 aa  97.1  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 497 aa  97.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 477 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 461 aa  94.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  25 
 
 		 450 aa  94  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  24.51 
 
 		 476 aa  93.6  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 457 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  27.79 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 478 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1098  hypothetical protein  26 
 
 		 488 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000776149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 481 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  27.01 
 
 		 459 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  25.76 
 
 		 451 aa  89.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 456 aa  89.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 463 aa  90.1  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  24.54 
 
 		 515 aa  89.7  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 456 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  24.75 
 
 		 459 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 472 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 476 aa  87.4  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 475 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  25.25 
 
 		 492 aa  87  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  22.97 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 514 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  25.89 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  24.69 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  27.22 
 
 		 467 aa  83.2  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1575  hypothetical protein  28.43 
 
 		 541 aa  83.2  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.0694567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  25 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  24.87 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  27.98 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 488 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  24.55 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  26.74 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4782  hypothetical protein  24.68 
 
 		 496 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.14161  hitchhiker  0.00605941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  24.71 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 613 aa  74.3  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 531 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  24.25 
 
 		 498 aa  73.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 664 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  22.87 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3289  hypothetical protein  24.3 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000775168  hitchhiker  0.000534443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  23.18 
 
 		 502 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5146  hypothetical protein  31.25 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000128117  hitchhiker  0.00789925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.32 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 496 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  26.89 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  24.4 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 466 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 519 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  28.66 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 574 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 540 aa  66.6  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  23.43 
 
 		 504 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>