More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1892 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1892  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 962 aa  1976    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  37.56 
 
 		 1008 aa  620  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6733  TonB-dependent receptor  33.3 
 
 		 1098 aa  456  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00154569  normal  0.0819442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1041 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4559  TonB-dependent receptor, plug  28.91 
 
 		 1010 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1888  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 1153 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  29.55 
 
 		 1028 aa  345  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  28.61 
 
 		 1127 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1063 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4977  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 1031 aa  317  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000497416  normal  0.504247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2438  TonB-dependent receptor plug  29.13 
 
 		 1129 aa  313  9e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1059 aa  300  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1169 aa  284  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1059 aa  283  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1153 aa  281  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3960  TonB-dependent receptor plug  27.79 
 
 		 1142 aa  279  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 1138 aa  277  8e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1051 aa  277  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  27.15 
 
 		 1058 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3553  TonB-dependent receptor plug  27.15 
 
 		 1081 aa  275  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.467854  decreased coverage  0.00228984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  28.54 
 
 		 1063 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1460  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 1065 aa  264  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 1166 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4562  TonB-dependent receptor, plug  26.77 
 
 		 1065 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2719  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 1073 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0834373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 1040 aa  259  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6611  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1137 aa  257  8e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1098  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 1105 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939091  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3367  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 1033 aa  253  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.994528 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04165  outer membrane protein  26.9 
 
 		 1071 aa  251  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6039  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1059 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  26.36 
 
 		 1032 aa  248  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0403  TonB-dependent receptor, plug  26.17 
 
 		 1083 aa  244  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 		 1043 aa  243  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 1074 aa  243  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1050 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1893  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1038 aa  240  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.41839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6466  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1147 aa  240  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000431216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  27.6 
 
 		 1115 aa  238  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0665  TonB-dependent receptor, plug  26.33 
 
 		 1051 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  24.61 
 
 		 1163 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0593  TonB-dependent receptor plug  25.66 
 
 		 1135 aa  233  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0125278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0458  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 1071 aa  231  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 1234 aa  228  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 1033 aa  228  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4131  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1027 aa  228  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28448  normal  0.339257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 1036 aa  227  9e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3031  TonB-dependent receptor plug  26.53 
 
 		 1022 aa  227  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0570  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 1088 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.7399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6791  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1138 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 1011 aa  224  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1102 aa  223  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4810  TonB-dependent receptor plug  25.15 
 
 		 1073 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0674411  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1165 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 1038 aa  215  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 1088 aa  212  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  24.46 
 
 		 1025 aa  211  6e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0206  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 1064 aa  210  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.676581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  23.71 
 
 		 1068 aa  209  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  25.05 
 
 		 1107 aa  208  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 1189 aa  207  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1047 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 1078 aa  201  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4175  TonB-dependent receptor plug  25.39 
 
 		 1099 aa  200  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000931261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3946  TonB-dependent receptor plug  24.98 
 
 		 1043 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  25.55 
 
 		 1176 aa  194  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  24.51 
 
 		 989 aa  193  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 1039 aa  191  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3959  TonB-dependent receptor plug  23.75 
 
 		 1044 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  0.166506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  23.49 
 
 		 1071 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1081 aa  177  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 1098 aa  177  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7182  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1186 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.893491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 1043 aa  174  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 1037 aa  172  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3400  TonB-dependent receptor plug  23.43 
 
 		 1057 aa  166  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0801  TonB-dependent receptor plug  24.42 
 
 		 1116 aa  165  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.353517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  24.18 
 
 		 986 aa  164  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  24.49 
 
 		 1018 aa  162  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 975 aa  161  6e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 1014 aa  160  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  23.52 
 
 		 1038 aa  159  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  23.99 
 
 		 1117 aa  157  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 1093 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 		 1000 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 1161 aa  155  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 1003 aa  154  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  24.23 
 
 		 1040 aa  154  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  23.86 
 
 		 988 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  23.85 
 
 		 1128 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 1011 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6166  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 977 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679734  decreased coverage  0.00200292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  23.07 
 
 		 1114 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 1096 aa  148  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  22.8 
 
 		 1124 aa  147  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 1023 aa  147  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  34.24 
 
 		 1081 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  24.86 
 
 		 1155 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  23.19 
 
 		 999 aa  146  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 1043 aa  145  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>