126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3723 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  100 
 
 		 330 aa  684    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  66.57 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  55.16 
 
 		 503 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  48.61 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  47.45 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  47.69 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  47.81 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  44.14 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  43.92 
 
 		 556 aa  195  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  41.11 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  38.17 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  39.37 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.34 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  37.33 
 
 		 694 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  37.55 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  38.21 
 
 		 641 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  38.21 
 
 		 642 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  37.92 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.59 
 
 		 1290 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  37.36 
 
 		 279 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.82 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  37.64 
 
 		 1321 aa  159  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  37.08 
 
 		 883 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.88 
 
 		 627 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  37.16 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  36.33 
 
 		 423 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  35.07 
 
 		 291 aa  155  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.46 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.36 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.06 
 
 		 532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.28 
 
 		 884 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  34.06 
 
 		 389 aa  149  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  35.71 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  37.46 
 
 		 1918 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  37.16 
 
 		 633 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  37.84 
 
 		 409 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.05 
 
 		 912 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  34.8 
 
 		 588 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.1 
 
 		 547 aa  143  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  35.61 
 
 		 1028 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.56 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.7 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.91 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.76 
 
 		 742 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  33.78 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  30.77 
 
 		 1059 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.55 
 
 		 1694 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  33.12 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  32.31 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  33.96 
 
 		 569 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  31.54 
 
 		 752 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  33.82 
 
 		 1441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 		 384 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3929  glycoside hydrolase family 16  33.1 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  36.26 
 
 		 1332 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.9 
 
 		 290 aa  116  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.54 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  29.67 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6434  glycoside hydrolase family 16  29.24 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  29.96 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.46 
 
 		 819 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  29.62 
 
 		 269 aa  95.9  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  28.21 
 
 		 346 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  29.37 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0584  glycoside hydrolase family 16  26.02 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.824584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  29.51 
 
 		 539 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  33.33 
 
 		 467 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0558  glycoside hydrolase family protein  29.54 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0874314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  29.41 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  29.82 
 
 		 319 aa  85.9  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  27.73 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  30.11 
 
 		 722 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 		 608 aa  80.1  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0560  glycoside hydrolase family 16  26.39 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  28.26 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  29.31 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  30 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  30.18 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  25.94 
 
 		 1707 aa  75.9  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  28.77 
 
 		 477 aa  75.9  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 907 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0981  b-glucosidase  26.84 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.849748  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  28.91 
 
 		 470 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  29.65 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.95 
 
 		 915 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2739  glycoside hydrolase family protein  27.64 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  0.433839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  28.76 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  27.23 
 
 		 842 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  28.8 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0284  glycoside hydrolase family 16  28.67 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  24.54 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10320  beta-1,3-glucanase precursor  29.14 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132676  normal  0.819711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0446  glycoside hydrolase family protein  26.2 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 		 686 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3037  glycoside hydrolase family 16  25.37 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0766336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>