More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB02640 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001306  ANIA_02963  subunit of the multiprotein cohesin complex (Eurofung)  40.7 
 
 		 1261 aa  895    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.869659  normal  0.319828 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02640  cohesin complex subunit psm1, putative  100 
 
 		 1202 aa  2458    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  33.81 
 
 		 1240 aa  642    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30705  predicted protein  33.15 
 
 		 1225 aa  601  1e-170  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  32.54 
 
 		 1237 aa  553  1e-156  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  24.3 
 
 		 1172 aa  242  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  23.48 
 
 		 1185 aa  240  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 		 1184 aa  202  3.9999999999999996e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  22.36 
 
 		 1196 aa  192  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  21.91 
 
 		 1191 aa  186  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  26.5 
 
 		 1146 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  22.11 
 
 		 1171 aa  176  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  25.48 
 
 		 1185 aa  163  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  23.74 
 
 		 1217 aa  162  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_242  predicted protein  24.93 
 
 		 1224 aa  162  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  24.4 
 
 		 1176 aa  161  9e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  25.17 
 
 		 1185 aa  161  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  25.5 
 
 		 1147 aa  159  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  24.47 
 
 		 1190 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  25.43 
 
 		 1187 aa  157  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  25.7 
 
 		 1199 aa  156  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  25.53 
 
 		 1199 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  25.25 
 
 		 1199 aa  155  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  24.9 
 
 		 1208 aa  154  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25.35 
 
 		 1193 aa  153  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  21.82 
 
 		 1181 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  23.85 
 
 		 1176 aa  147  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  24.12 
 
 		 1184 aa  146  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.93 
 
 		 1201 aa  143  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  23.89 
 
 		 1177 aa  142  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  24.36 
 
 		 1183 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  24.64 
 
 		 1198 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 		 1146 aa  139  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.38 
 
 		 1194 aa  138  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00970  conserved hypothetical protein  33.95 
 
 		 1540 aa  137  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.895196  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44165  predicted protein  35.76 
 
 		 1356 aa  134  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.33 
 
 		 1134 aa  132  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  24.89 
 
 		 1082 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  20.27 
 
 		 1174 aa  128  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  33.66 
 
 		 1191 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  32.41 
 
 		 1192 aa  124  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  31.96 
 
 		 1149 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1189 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  20.83 
 
 		 1153 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02930  chromosome associated protein, putative  22.83 
 
 		 1208 aa  119  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.828344  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  31.46 
 
 		 1189 aa  118  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  23.45 
 
 		 1177 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  31.46 
 
 		 1171 aa  115  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  22.51 
 
 		 1189 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  23.1 
 
 		 1189 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  29.27 
 
 		 1219 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  34.87 
 
 		 1476 aa  113  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  31.37 
 
 		 1175 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  30.29 
 
 		 1196 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  23.24 
 
 		 1226 aa  112  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  31.34 
 
 		 1148 aa  112  6e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.08 
 
 		 1180 aa  111  8.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  30.59 
 
 		 1174 aa  110  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  32.07 
 
 		 1188 aa  110  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  22.69 
 
 		 1403 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  29.01 
 
 		 1162 aa  109  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  23.7 
 
 		 1174 aa  109  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  29.01 
 
 		 1162 aa  108  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1198 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  33.46 
 
 		 1162 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  22.09 
 
 		 1189 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  29.85 
 
 		 1204 aa  106  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  30 
 
 		 1226 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  27.73 
 
 		 1167 aa  106  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  33.46 
 
 		 1162 aa  106  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  33.69 
 
 		 1187 aa  106  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  32.6 
 
 		 1190 aa  106  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  29.61 
 
 		 1195 aa  106  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  33.46 
 
 		 1162 aa  106  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  34.82 
 
 		 1167 aa  105  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  34.6 
 
 		 1185 aa  105  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  33.64 
 
 		 1139 aa  104  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  24.46 
 
 		 1186 aa  104  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  22.65 
 
 		 1213 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  24.84 
 
 		 814 aa  103  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  35.93 
 
 		 1175 aa  103  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  32.72 
 
 		 1162 aa  103  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  29.11 
 
 		 1198 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  34.31 
 
 		 1140 aa  103  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.36 
 
 		 1196 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  28.36 
 
 		 1196 aa  102  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  32.43 
 
 		 1165 aa  102  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0163  chromosome segregation protein SMC  30.91 
 
 		 1150 aa  102  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  29.3 
 
 		 1148 aa  102  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  30.85 
 
 		 1145 aa  102  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  32.51 
 
 		 1188 aa  102  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  32.51 
 
 		 1188 aa  102  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  28.86 
 
 		 1169 aa  102  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2738  chromosome segregation protein SMC  33.62 
 
 		 1167 aa  102  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  35.29 
 
 		 1185 aa  101  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  21.89 
 
 		 1178 aa  101  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  36.81 
 
 		 1162 aa  101  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  36.81 
 
 		 1162 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  28.86 
 
 		 1169 aa  100  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  31.39 
 
 		 1190 aa  101  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>