More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4689 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_03271  hypothetical protein  41.48 
 
 		 1184 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  39.1 
 
 		 1183 aa  788    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  57.29 
 
 		 1226 aa  1289    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1208 aa  2440    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  58.43 
 
 		 1190 aa  1285    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  59.06 
 
 		 1198 aa  1244    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0425  chromosome segregation protein SMC  41.55 
 
 		 1204 aa  793    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.501211  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2255  condensin subunit Smc  43.43 
 
 		 1202 aa  782    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.204212 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  37.91 
 
 		 1196 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2045  condensin subunit Smc  54.24 
 
 		 1195 aa  1061    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  38 
 
 		 1194 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  73.17 
 
 		 1217 aa  1782    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  37.08 
 
 		 1196 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  41.12 
 
 		 1207 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  39.31 
 
 		 1201 aa  814    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  57.63 
 
 		 1219 aa  1349    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  56.92 
 
 		 1226 aa  1280    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  37.55 
 
 		 1196 aa  729    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  33.55 
 
 		 1175 aa  590  1e-167  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  31.73 
 
 		 1174 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  33.17 
 
 		 1171 aa  544  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  32.15 
 
 		 1192 aa  543  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  32.44 
 
 		 1189 aa  518  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  30.98 
 
 		 1193 aa  515  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  31.39 
 
 		 1146 aa  499  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  31.61 
 
 		 1149 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  30.86 
 
 		 1146 aa  491  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  31.14 
 
 		 1146 aa  489  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  29.31 
 
 		 1184 aa  450  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  26.79 
 
 		 1191 aa  376  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  33.24 
 
 		 1147 aa  365  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  26.37 
 
 		 1189 aa  364  6e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  25.71 
 
 		 1189 aa  349  2e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  25.6 
 
 		 1189 aa  347  8e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  25.66 
 
 		 1189 aa  346  2e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  25.25 
 
 		 1185 aa  325  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  26.67 
 
 		 1187 aa  323  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  26.44 
 
 		 1188 aa  323  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  26.44 
 
 		 1188 aa  323  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25.77 
 
 		 1185 aa  309  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  25.98 
 
 		 1189 aa  300  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  25.47 
 
 		 1189 aa  300  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  25.12 
 
 		 1190 aa  299  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 		 1189 aa  295  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  26.87 
 
 		 1174 aa  291  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  26.09 
 
 		 1189 aa  291  5.0000000000000004e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  25.1 
 
 		 1189 aa  291  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  29.69 
 
 		 1172 aa  290  8e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  25.1 
 
 		 1189 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  25.02 
 
 		 1189 aa  287  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  25.02 
 
 		 1189 aa  287  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  24.94 
 
 		 1189 aa  287  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  24.94 
 
 		 1189 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  24.94 
 
 		 1189 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  25.18 
 
 		 1190 aa  282  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 		 1196 aa  278  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.64 
 
 		 1187 aa  279  3e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.11 
 
 		 1189 aa  276  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  25.47 
 
 		 1187 aa  275  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  23.32 
 
 		 1191 aa  273  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  25.91 
 
 		 1186 aa  272  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  24.64 
 
 		 1174 aa  270  1e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  24.84 
 
 		 1184 aa  266  1e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  29.4 
 
 		 1148 aa  261  5.0000000000000005e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  26.54 
 
 		 1177 aa  260  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  26.09 
 
 		 1179 aa  259  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  25.08 
 
 		 1186 aa  258  7e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  24.64 
 
 		 1148 aa  249  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  24.51 
 
 		 1170 aa  249  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  24.52 
 
 		 1170 aa  247  9e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  22.48 
 
 		 1178 aa  245  3.9999999999999997e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  25.5 
 
 		 1185 aa  242  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  23.99 
 
 		 1177 aa  241  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  23.32 
 
 		 1174 aa  241  5.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.26 
 
 		 1134 aa  239  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  24.25 
 
 		 1204 aa  238  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  23.37 
 
 		 1180 aa  238  6e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  24.46 
 
 		 1199 aa  237  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  26.4 
 
 		 1186 aa  235  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  25.21 
 
 		 1162 aa  236  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  25.89 
 
 		 1179 aa  234  8.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.17 
 
 		 1164 aa  233  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  26.11 
 
 		 1179 aa  231  9e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  25.18 
 
 		 1162 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  33.79 
 
 		 1188 aa  229  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 		 1201 aa  227  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  25.96 
 
 		 1308 aa  226  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1341  chromosome segregation protein SMC  33.02 
 
 		 1196 aa  224  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  24.53 
 
 		 1171 aa  224  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  23.17 
 
 		 1191 aa  222  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  24.22 
 
 		 1476 aa  220  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  24.06 
 
 		 1176 aa  220  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.03 
 
 		 1153 aa  220  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64147  Structural maintenance of chromosome protein 1 (sister chromatid cohesion complex Cohesin, subunit SMC1)  24.24 
 
 		 1240 aa  219  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.471232 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  23.5 
 
 		 1176 aa  220  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  22.2 
 
 		 1172 aa  216  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0855  chromosome segregation protein SMC  25.39 
 
 		 1200 aa  214  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00379552  normal  0.0307887 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06364  Chromosome segregation protein sudA (DA-box protein sudA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00737]  23.33 
 
 		 1215 aa  213  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  25.4 
 
 		 1181 aa  212  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  24.63 
 
 		 1403 aa  211  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>