More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3571 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  43.82 
 
 		 1022 aa  651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 954 aa  1847    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  41.06 
 
 		 1108 aa  595  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  37.22 
 
 		 1021 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  36.12 
 
 		 971 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  56.05 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  38.78 
 
 		 950 aa  416  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  36.28 
 
 		 1003 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  34.69 
 
 		 981 aa  402  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3432  transcriptional regulator, SARP family  40.03 
 
 		 775 aa  399  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00818273  normal  0.368034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  35.32 
 
 		 1025 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 		 992 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  34.86 
 
 		 992 aa  389  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 654 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  35.01 
 
 		 1025 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  39.57 
 
 		 621 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  41.1 
 
 		 1030 aa  366  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  35.46 
 
 		 940 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1017 aa  364  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  35.87 
 
 		 921 aa  363  8e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4296  transcriptional regulator, SARP family  33.63 
 
 		 996 aa  360  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.300157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4482  transcriptional regulator, SARP family  33.4 
 
 		 941 aa  359  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434883  normal  0.14218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  33.22 
 
 		 1022 aa  358  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  32.91 
 
 		 934 aa  355  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  40.88 
 
 		 990 aa  353  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  39.94 
 
 		 1014 aa  352  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  33.37 
 
 		 913 aa  351  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 		 931 aa  348  2e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  33.01 
 
 		 1020 aa  345  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  34.9 
 
 		 990 aa  343  9e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  34.54 
 
 		 963 aa  338  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0205  transcriptional regulator, SARP family  36.23 
 
 		 1088 aa  333  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 1071 aa  332  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  33.52 
 
 		 964 aa  331  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  32.98 
 
 		 1010 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 1319 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  31.68 
 
 		 946 aa  322  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  32.93 
 
 		 1003 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  31.84 
 
 		 1011 aa  318  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  33.87 
 
 		 993 aa  313  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  43.03 
 
 		 496 aa  312  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 1346 aa  311  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5355  transcriptional regulator, SARP family  39.16 
 
 		 1138 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.610748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  35.37 
 
 		 965 aa  308  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  32.17 
 
 		 919 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3874  transcriptional regulator, SARP family  34.28 
 
 		 935 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.841165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1875  transcriptional regulator, SARP family  32.55 
 
 		 921 aa  304  5.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0222305  decreased coverage  0.00126827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6410  transcriptional regulator, SARP family  32.17 
 
 		 970 aa  300  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.83 
 
 		 1013 aa  298  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0196  transcriptional regulator, SARP family  31.57 
 
 		 967 aa  297  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46607  normal  0.0345978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  31.7 
 
 		 930 aa  297  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  34.56 
 
 		 995 aa  296  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4465  transcriptional regulator, SARP family  43.06 
 
 		 1024 aa  296  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 1008 aa  293  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.87 
 
 		 1033 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2430  transcriptional regulator, SARP family  36.11 
 
 		 612 aa  290  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  40.27 
 
 		 926 aa  287  5.999999999999999e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  31.44 
 
 		 965 aa  284  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3887  transcriptional regulator, SARP family  37.46 
 
 		 666 aa  284  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000943372  normal  0.402378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 1048 aa  284  7.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1768  transcriptional regulator, SARP family  31.07 
 
 		 907 aa  281  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523218  normal  0.689906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  41.65 
 
 		 915 aa  281  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  32.19 
 
 		 962 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  29.89 
 
 		 1027 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5280  transcriptional regulator, SARP family  37.84 
 
 		 632 aa  278  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  38.21 
 
 		 910 aa  278  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  34.07 
 
 		 956 aa  277  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0601  transcriptional regulator, SARP family  31.84 
 
 		 928 aa  276  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  34.59 
 
 		 1001 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4139  transcriptional regulator, SARP family  33.94 
 
 		 983 aa  273  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.180514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  32.93 
 
 		 910 aa  268  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3801  transcriptional regulator, SARP family  29.63 
 
 		 993 aa  267  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000525265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6346  transcriptional regulator, SARP family  30.61 
 
 		 1034 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  30.59 
 
 		 908 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  36.53 
 
 		 631 aa  265  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  33.57 
 
 		 989 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  40.51 
 
 		 994 aa  258  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  31.29 
 
 		 1054 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  33.81 
 
 		 981 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4597  transcriptional regulator, SARP family  38.15 
 
 		 582 aa  256  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  31.56 
 
 		 1003 aa  251  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  30.27 
 
 		 928 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 622 aa  244  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  33.38 
 
 		 850 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1985  NB-ARC domain protein  33.01 
 
 		 797 aa  242  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00414294  normal  0.784778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5833  transcriptional regulator, SARP family  30.27 
 
 		 937 aa  241  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  33.28 
 
 		 788 aa  239  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  32.3 
 
 		 1030 aa  239  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.998552 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3782  transcriptional regulator, SARP family  29.8 
 
 		 982 aa  237  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.519842  hitchhiker  0.00738187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  33.38 
 
 		 790 aa  237  9e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  33.09 
 
 		 915 aa  228  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 621 aa  226  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3942  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 		 755 aa  221  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058875  normal  0.0427407 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  30.97 
 
 		 978 aa  218  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6871  hypothetical protein  31.57 
 
 		 854 aa  217  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  37.04 
 
 		 1000 aa  217  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6658  NB-ARC domain protein  31.16 
 
 		 783 aa  215  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699604  normal  0.571169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  30.97 
 
 		 806 aa  214  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  30.6 
 
 		 896 aa  210  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0225  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 792 aa  210  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.312331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>