201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0703 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  427  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  79.9 
 
 		 207 aa  330  8e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 201 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 208 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  34.76 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  33.73 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  29.61 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 321 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 189 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.56 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  31 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 180 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  29.7 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  31.17 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3554  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.725934  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  31.03 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 232 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1805  hypothetical protein  28.71 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  29.63 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>