84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0021 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0021  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  644    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0025  type IV pilus assembly protein PilW  97.47 
 
 		 316 aa  610  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  34.82 
 
 		 343 aa  185  7e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2272  type IV pilus assembly protein PilW  29.44 
 
 		 342 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2157  hypothetical protein  27.27 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000787973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3227  hypothetical protein  24.7 
 
 		 341 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  27.58 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0684  hypothetical protein  24.55 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0667  hypothetical protein  24.55 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01322  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  32.28 
 
 		 388 aa  68.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  37.5 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  32.02 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0868  Tfp pilus assembly protein PilW-like  23.05 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0553182  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1380  hypothetical protein  46.27 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.175236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2560  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  24.7 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24572  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0715  type IV pilus assembly protein PilW  27.4 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3105  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  34.57 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0672  type IV pilus assembly protein PilW  27.12 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  31.31 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2718  type IV pilus assembly protein PilW  43.94 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1705  hypothetical protein  23.17 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1767  type IV pilus assembly protein PilW  23.17 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.846676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1088  type IV pilus assembly protein PilW  40.28 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0649  hypothetical protein  36 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  33.78 
 
 		 237 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1199  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  35.62 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0624934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1126  type IV pilus assembly protein PilW  38.46 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3230  hypothetical protein  40.32 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1161  type IV pilus assembly protein PilW  40.32 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1059  type IV pilus assembly protein PilW  40.32 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0855  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  40.28 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3131  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.67 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3167  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  40.28 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0089  pilin-like protein  35.96 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1064  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  37.5 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2911  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  31.03 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364706  normal  0.0141201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1104  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  34.72 
 
 		 328 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2553  Type II secretory pathway component PulJ-like  39.71 
 
 		 236 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3034  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  40 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0770225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0609  hypothetical protein  37.33 
 
 		 214 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  28.35 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1296  type IV pilus assembly protein PilW  41.67 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.488119 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2952  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  38.33 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.501472  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1863  hypothetical protein  41.27 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2885  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  38.71 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0965  N-terminal methylation  35.48 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5195  hypothetical protein  38.89 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.859516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4553  hypothetical protein  38.57 
 
 		 215 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2683  hypothetical protein  24.03 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.56779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0929  type IV pilus assembly protein PilW  37.31 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0491  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  32.2 
 
 		 226 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0524  hypothetical protein  25.53 
 
 		 217 aa  50.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0218  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  37.5 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.829612  normal  0.145783 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0255  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.36 
 
 		 226 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3527  hypothetical protein  38.6 
 
 		 312 aa  49.3  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2537  hypothetical protein  35.48 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3252  Type IV pili fiber-building block protein  33.8 
 
 		 193 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11850  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilW-like protein  32.1 
 
 		 395 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.983551  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03025  pilin like competence factor  38.71 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651646  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0264  putative pilus assembly protein PilW  37.33 
 
 		 334 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.43803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0190  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein precursor  27.42 
 
 		 242 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3038  hypothetical protein  38.71 
 
 		 332 aa  46.2  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0541316  normal  0.15459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1160  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  37.7 
 
 		 207 aa  46.2  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0769  hypothetical protein  21.35 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5182  hypothetical protein  31.67 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0333814  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0235  pilus assembly protein PilW  38.81 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2942  fimbrial biogenesis protein  36.84 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.661552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1214  hypothetical protein  34.48 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0502  Tfp pilus assembly protein PilW-like protein  22.15 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0785  putative Tfp pilus assembly protein PilW  40.35 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.964306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3911  hypothetical protein  21.79 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  28.92 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3173  prepilin-type cleavage/methylation-like  32.98 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0213  hypothetical protein  34.72 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  34.21 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  34.21 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  34.21 
 
 		 282 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2002  hypothetical protein  34.38 
 
 		 397 aa  43.5  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00963424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2092  hypothetical protein  24.24 
 
 		 160 aa  43.1  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.473403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3553  putative transmembrane protein  33.87 
 
 		 349 aa  43.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1290  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.03 
 
 		 250 aa  43.1  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791156 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  33.8 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  33.8 
 
 		 287 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>