188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1906 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  72.51 
 
 		 1118 aa  759    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  71.72 
 
 		 1113 aa  749    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  68.76 
 
 		 1340 aa  1049    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  68.63 
 
 		 889 aa  736    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  60.02 
 
 		 2062 aa  1088    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 2194 aa  4351    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  60 
 
 		 1222 aa  776    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  58.37 
 
 		 1225 aa  752    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  57.19 
 
 		 1012 aa  600  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  55.21 
 
 		 1289 aa  531  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.32 
 
 		 1009 aa  408  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.87 
 
 		 891 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.99 
 
 		 1800 aa  374  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  55.76 
 
 		 995 aa  353  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  55.72 
 
 		 1019 aa  348  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.51 
 
 		 1269 aa  325  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.37 
 
 		 1269 aa  323  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.71 
 
 		 1661 aa  286  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  45.45 
 
 		 1838 aa  265  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  31.59 
 
 		 2310 aa  255  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  31.68 
 
 		 2305 aa  254  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  28.87 
 
 		 1029 aa  254  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.72 
 
 		 1029 aa  253  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  40.36 
 
 		 1037 aa  239  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  44.32 
 
 		 828 aa  233  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  42.27 
 
 		 2807 aa  231  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  41.19 
 
 		 412 aa  209  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  40.96 
 
 		 386 aa  208  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.87 
 
 		 928 aa  207  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  37.76 
 
 		 1557 aa  202  3.9999999999999996e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  27.44 
 
 		 5899 aa  197  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  38.48 
 
 		 644 aa  187  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  39.08 
 
 		 872 aa  186  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  38.3 
 
 		 1126 aa  176  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  27.65 
 
 		 4013 aa  176  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.51 
 
 		 3396 aa  174  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  37.58 
 
 		 1275 aa  173  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  39.2 
 
 		 662 aa  171  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  36.34 
 
 		 1490 aa  170  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  37.82 
 
 		 974 aa  168  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  31.75 
 
 		 4379 aa  164  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  34.4 
 
 		 554 aa  161  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  36.63 
 
 		 813 aa  160  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  34.03 
 
 		 616 aa  158  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  37.03 
 
 		 604 aa  157  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.91 
 
 		 768 aa  152  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1289 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  26.17 
 
 		 4689 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.47 
 
 		 1415 aa  130  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  25.28 
 
 		 2127 aa  124  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.21 
 
 		 1143 aa  114  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  37.05 
 
 		 663 aa  114  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.68 
 
 		 3168 aa  110  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  30.43 
 
 		 472 aa  106  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  29.87 
 
 		 469 aa  106  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.64 
 
 		 1180 aa  105  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  31.59 
 
 		 657 aa  102  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  32.18 
 
 		 494 aa  101  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2106  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1058 aa  99.8  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.866139  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  22.99 
 
 		 2042 aa  97.8  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  31.56 
 
 		 3197 aa  96.7  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  30.99 
 
 		 685 aa  94.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  33.96 
 
 		 1124 aa  91.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  30.2 
 
 		 485 aa  91.3  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.09 
 
 		 3197 aa  90.5  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  29.36 
 
 		 917 aa  82.8  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  38.32 
 
 		 894 aa  82.4  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.62 
 
 		 8871 aa  81.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  49.04 
 
 		 161 aa  80.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.4 
 
 		 647 aa  81.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  34.58 
 
 		 894 aa  80.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  42.31 
 
 		 7149 aa  80.9  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1638 aa  77.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  35.06 
 
 		 837 aa  78.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0736  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.88 
 
 		 1021 aa  77.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.23 
 
 		 5098 aa  78.2  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5616  hypothetical protein  32.54 
 
 		 427 aa  77  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  29.87 
 
 		 5444 aa  77  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.84 
 
 		 547 aa  76.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.17 
 
 		 11716 aa  74.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2814  peptidase-like  42.73 
 
 		 2334 aa  72.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  28.74 
 
 		 510 aa  70.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.45 
 
 		 1092 aa  69.3  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1892  peptidase-like  40.57 
 
 		 863 aa  69.3  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  31.74 
 
 		 1022 aa  68.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.09 
 
 		 1091 aa  67.4  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  30.83 
 
 		 1053 aa  67.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  38.4 
 
 		 16311 aa  67  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  37.96 
 
 		 2632 aa  66.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1461  peptidase-like  28.06 
 
 		 715 aa  65.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.264021  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.25 
 
 		 2796 aa  65.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  33.63 
 
 		 1156 aa  65.9  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.74 
 
 		 2281 aa  65.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  35.96 
 
 		 1594 aa  64.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1210 aa  63.9  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.57 
 
 		 959 aa  63.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  26.68 
 
 		 1527 aa  63.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.06 
 
 		 1192 aa  62.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  30.16 
 
 		 456 aa  62.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  22.99 
 
 		 668 aa  61.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>