More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  47.16 
 
 		 893 aa  651    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 881 aa  759    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 881 aa  759    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  53.99 
 
 		 876 aa  751    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 894 aa  1722    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  46.11 
 
 		 910 aa  568  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1352  tetratricopeptide TPR_4  50.67 
 
 		 683 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  34.58 
 
 		 927 aa  326  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  34.96 
 
 		 959 aa  322  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 1000 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  68.54 
 
 		 189 aa  224  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.35 
 
 		 953 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  44.52 
 
 		 919 aa  107  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 919 aa  98.6  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  26.89 
 
 		 919 aa  98.6  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.52 
 
 		 923 aa  97.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  44.7 
 
 		 938 aa  96.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  50.81 
 
 		 904 aa  95.9  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  32.93 
 
 		 921 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  43.15 
 
 		 947 aa  95.5  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  26.65 
 
 		 919 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  32.08 
 
 		 928 aa  94.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  39.1 
 
 		 940 aa  94.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.33 
 
 		 937 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 937 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  37.33 
 
 		 937 aa  93.6  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  42.98 
 
 		 927 aa  92.8  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  42.76 
 
 		 894 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 889 aa  90.9  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  39.19 
 
 		 940 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  38.95 
 
 		 897 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  35.91 
 
 		 910 aa  90.1  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 		 929 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  40.14 
 
 		 977 aa  89  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 903 aa  88.2  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  33.64 
 
 		 921 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 921 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  45.57 
 
 		 932 aa  87  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  33.64 
 
 		 921 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  38.67 
 
 		 929 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  42.74 
 
 		 905 aa  87.4  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  41.8 
 
 		 928 aa  86.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 877 aa  86.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  26.13 
 
 		 923 aa  84.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 913 aa  84  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  42.22 
 
 		 913 aa  84  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  41.91 
 
 		 884 aa  84  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  37.24 
 
 		 925 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  35.1 
 
 		 919 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  38 
 
 		 541 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 936 aa  81.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  42.28 
 
 		 928 aa  80.9  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  40.34 
 
 		 930 aa  80.9  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  38.12 
 
 		 879 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 911 aa  80.9  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  41.8 
 
 		 884 aa  80.9  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  29.06 
 
 		 900 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  43.65 
 
 		 892 aa  79.7  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  38.06 
 
 		 917 aa  79  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 998 aa  78.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  39.58 
 
 		 920 aa  77.8  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  39.6 
 
 		 552 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  37.31 
 
 		 961 aa  76.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 236 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  37.16 
 
 		 951 aa  75.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  43.85 
 
 		 960 aa  76.3  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 915 aa  75.1  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  37.5 
 
 		 923 aa  75.1  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  37.91 
 
 		 922 aa  74.3  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  34.34 
 
 		 955 aa  74.3  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  43.09 
 
 		 927 aa  73.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  41.13 
 
 		 946 aa  72.8  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.23 
 
 		 1013 aa  72  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 953 aa  71.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 909 aa  70.5  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  35.05 
 
 		 974 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 1064 aa  68.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  28.93 
 
 		 943 aa  68.6  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  37.09 
 
 		 1006 aa  67.8  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 929 aa  67.8  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  32.95 
 
 		 946 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 923 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 919 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  31.04 
 
 		 907 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 		 835 aa  67  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 916 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 918 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.38 
 
 		 214 aa  66.2  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2563  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  32.52 
 
 		 973 aa  64.3  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 882 aa  64.3  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 950 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 421 aa  63.9  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  33.51 
 
 		 855 aa  63.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 948 aa  63.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 221 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>