174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2156 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  100 
 
 
352 aa  725    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  84.03 
 
 
357 aa  629  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  83.99 
 
 
355 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  83.99 
 
 
356 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  83.15 
 
 
355 aa  615  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  69.52 
 
 
341 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  62.89 
 
 
346 aa  429  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  53.61 
 
 
327 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  47.64 
 
 
315 aa  279  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  40.56 
 
 
598 aa  226  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  39.94 
 
 
343 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  40.62 
 
 
491 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  41.22 
 
 
472 aa  210  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  37.5 
 
 
366 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  39.4 
 
 
331 aa  205  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  38.49 
 
 
319 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  37.75 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  35.29 
 
 
379 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  33.94 
 
 
472 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  31.56 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  31.42 
 
 
537 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 
503 aa  132  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  31.69 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  28.32 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  30.04 
 
 
510 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.99 
 
 
699 aa  122  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  32.29 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  29.01 
 
 
386 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  28.61 
 
 
471 aa  109  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  30.13 
 
 
320 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  30.58 
 
 
480 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  27.81 
 
 
471 aa  103  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.75 
 
 
524 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  26.05 
 
 
707 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  25.8 
 
 
475 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  25.62 
 
 
476 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  26.14 
 
 
789 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  27.99 
 
 
456 aa  95.5  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.45 
 
 
810 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  27.36 
 
 
522 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  29.35 
 
 
703 aa  92  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  27.03 
 
 
501 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  28.13 
 
 
1112 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  28.67 
 
 
804 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 
829 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 
1121 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  25.84 
 
 
494 aa  86.7  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  27.93 
 
 
1121 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  28.77 
 
 
1121 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  26.37 
 
 
488 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  26.95 
 
 
848 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 
1143 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.35 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  23.33 
 
 
531 aa  74.3  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  24.91 
 
 
537 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  27.02 
 
 
533 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  24.25 
 
 
537 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.62 
 
 
495 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  26.42 
 
 
487 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  24.03 
 
 
497 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  23.96 
 
 
581 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  27.95 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  26.29 
 
 
509 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  26.82 
 
 
1174 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  22.68 
 
 
536 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  24.68 
 
 
484 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.76 
 
 
562 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  23.95 
 
 
497 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  24.01 
 
 
534 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.19 
 
 
540 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 
572 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  21.57 
 
 
545 aa  63.5  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  27.27 
 
 
523 aa  62.8  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  26.42 
 
 
546 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  24.76 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  28.02 
 
 
512 aa  62  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  22.41 
 
 
547 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  21.88 
 
 
535 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  24.04 
 
 
512 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  26.48 
 
 
330 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  27.31 
 
 
563 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  25.44 
 
 
348 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.02 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  23.1 
 
 
511 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  23.92 
 
 
532 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  24.43 
 
 
517 aa  60.8  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  24.65 
 
 
306 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  27.34 
 
 
524 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  25.72 
 
 
401 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  24.36 
 
 
551 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  25.15 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.812392 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  23.08 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  22.83 
 
 
450 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  21.54 
 
 
492 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  23.42 
 
 
516 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.52 
 
 
346 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  25.48 
 
 
1186 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 
315 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>