More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0183 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  41.73 
 
 		 1822 aa  1007    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  34.57 
 
 		 1748 aa  762    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  42.9 
 
 		 1837 aa  1126    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  44.84 
 
 		 1663 aa  1147    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  44.65 
 
 		 1668 aa  1152    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  29.51 
 
 		 2279 aa  640    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  32.43 
 
 		 2361 aa  738    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.01 
 
 		 1780 aa  802    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.05 
 
 		 1901 aa  789    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.2 
 
 		 1805 aa  759    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  30.19 
 
 		 1934 aa  700    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.82 
 
 		 1804 aa  800    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.45 
 
 		 2017 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.03 
 
 		 1794 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  28.83 
 
 		 1850 aa  795    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.66 
 
 		 1797 aa  739    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.15 
 
 		 1795 aa  756    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.38 
 
 		 1808 aa  761    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  30.94 
 
 		 1922 aa  693    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  41.99 
 
 		 1809 aa  1137    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  42.34 
 
 		 1845 aa  1137    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  31.11 
 
 		 2272 aa  660    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  100 
 
 		 1697 aa  3454    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  38.23 
 
 		 1836 aa  933    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  82.58 
 
 		 427 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  30.4 
 
 		 1685 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  35.63 
 
 		 1685 aa  827    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 1914 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.46 
 
 		 1774 aa  740    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  32.03 
 
 		 1744 aa  699    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  30.27 
 
 		 2051 aa  756    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  73.13 
 
 		 1712 aa  2494    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  27.77 
 
 		 1811 aa  680    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 1805 aa  724    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 		 1932 aa  716    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  31.62 
 
 		 1871 aa  680    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  35.48 
 
 		 1685 aa  829    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 1942 aa  704    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  32.23 
 
 		 1908 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  40.62 
 
 		 1833 aa  999    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  30.16 
 
 		 1682 aa  635  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  30.91 
 
 		 1710 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  30.32 
 
 		 2303 aa  635  1e-180  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  29.58 
 
 		 1682 aa  632  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 		 1644 aa  620  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.12 
 
 		 1780 aa  615  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  30.87 
 
 		 1885 aa  590  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  29.04 
 
 		 1739 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  31.93 
 
 		 2109 aa  551  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  30.73 
 
 		 2077 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.31 
 
 		 1797 aa  483  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.72 
 
 		 1885 aa  465  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.35 
 
 		 1832 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  28.07 
 
 		 1788 aa  432  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  33.48 
 
 		 670 aa  417  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  27.02 
 
 		 1756 aa  400  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 		 1637 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  28.54 
 
 		 1643 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 1123 aa  366  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 1636 aa  363  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 1629 aa  359  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  26.93 
 
 		 1726 aa  302  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  25.65 
 
 		 1064 aa  300  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  25.82 
 
 		 1112 aa  298  5e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  28.07 
 
 		 1649 aa  253  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.21 
 
 		 1060 aa  253  3e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  24.62 
 
 		 1473 aa  244  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  24.62 
 
 		 1473 aa  244  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  24.69 
 
 		 1473 aa  243  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  23.35 
 
 		 1123 aa  232  6e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  48.95 
 
 		 779 aa  228  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 		 657 aa  214  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 636 aa  214  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 739 aa  213  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 773 aa  213  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 		 803 aa  209  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 494 aa  203  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 875 aa  200  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 713 aa  200  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  42.92 
 
 		 356 aa  198  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 		 515 aa  198  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  42.13 
 
 		 406 aa  196  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 733 aa  195  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 		 975 aa  192  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 640 aa  192  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 886 aa  192  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 851 aa  191  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  22.52 
 
 		 1255 aa  190  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 1000 aa  186  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 632 aa  186  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 632 aa  186  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 632 aa  186  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 484 aa  185  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 729 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 666 aa  179  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 1211 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  34.98 
 
 		 355 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  23.11 
 
 		 900 aa  177  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  33.45 
 
 		 357 aa  174  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 902 aa  174  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>