More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1422 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  100 
 
 
442 aa  915  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  100 
 
 
393 aa  813  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  27.08 
 
 
369 aa  185  1e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  31.71 
 
 
409 aa  185  2e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.92 
 
 
369 aa  184  2e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  29.7 
 
 
387 aa  179  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.9 
 
 
370 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  31.36 
 
 
403 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  27.23 
 
 
369 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  1.20563e-05 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.68 
 
 
368 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.75 
 
 
390 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  35.29 
 
 
370 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  26.05 
 
 
381 aa  174  3e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.65595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  30.07 
 
 
463 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  35.17 
 
 
374 aa  165  1e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  35.17 
 
 
374 aa  165  1e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  40.08 
 
 
379 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.24 
 
 
389 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  27.1 
 
 
431 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  35.17 
 
 
363 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  35.86 
 
 
325 aa  149  1e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.05 
 
 
377 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  31.33 
 
 
373 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  27.51 
 
 
383 aa  145  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  26.89 
 
 
386 aa  144  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  33.59 
 
 
378 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  35.63 
 
 
404 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.41 
 
 
392 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.94 
 
 
435 aa  142  1e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.94 
 
 
388 aa  140  5e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  34.5 
 
 
414 aa  139  8e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  32.55 
 
 
305 aa  137  3e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  32.26 
 
 
392 aa  137  3e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  33.33 
 
 
378 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.62 
 
 
385 aa  137  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.19227e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.21 
 
 
413 aa  136  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  29.15 
 
 
471 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  29.15 
 
 
471 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  29.74 
 
 
383 aa  131  2e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25 
 
 
391 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  27.29 
 
 
477 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  35.2 
 
 
391 aa  129  2e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  27.44 
 
 
386 aa  127  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  30.53 
 
 
400 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  40.32 
 
 
487 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  26.59 
 
 
422 aa  126  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  32.13 
 
 
391 aa  126  8e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  27.76 
 
 
357 aa  126  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  32.81 
 
 
377 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  27.56 
 
 
378 aa  120  4e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  25.52 
 
 
422 aa  119  1e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  32.51 
 
 
374 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  25.5 
 
 
402 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  24 
 
 
376 aa  112  1e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  23.91 
 
 
393 aa  112  2e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  27.27 
 
 
384 aa  110  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  23.38 
 
 
370 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.43 
 
 
376 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.43 
 
 
376 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  25.74 
 
 
508 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  25.74 
 
 
508 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  25.84 
 
 
656 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  26.17 
 
 
381 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  24.94 
 
 
506 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  5.91844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  39.38 
 
 
429 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  26.17 
 
 
381 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  23.01 
 
 
393 aa  103  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  20.64 
 
 
376 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  27.91 
 
 
443 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  28.1 
 
 
371 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  33.51 
 
 
201 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  27.15 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  25.77 
 
 
494 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  29.06 
 
 
391 aa  96.7  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  29.93 
 
 
426 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  27.01 
 
 
377 aa  96.3  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  28.51 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  27.27 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  28.51 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  26.3 
 
 
492 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  26.32 
 
 
443 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  22.68 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.52 
 
 
416 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  23.75 
 
 
376 aa  91.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  26.74 
 
 
437 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  25.96 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  7.33221e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  26.52 
 
 
428 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  5.30695e-05 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  26.17 
 
 
465 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  27.24 
 
 
454 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  22.16 
 
 
376 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  9.13824e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2337  hypothetical protein  40.54 
 
 
120 aa  85.1  2e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  24.36 
 
 
367 aa  85.1  2e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2157  hypothetical protein  40.54 
 
 
120 aa  85.1  2e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00218836  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.18 
 
 
398 aa  85.1  2e-15  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2095  phage integrase  40.54 
 
 
120 aa  85.1  2e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.41723e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2312  hypothetical protein  40.54 
 
 
120 aa  85.1  2e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.430324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  35.9 
 
 
121 aa  84.7  3e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  23.33 
 
 
423 aa  84  5e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.885e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  27.34 
 
 
404 aa  83.2  8e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0546  integrase family protein  26.27 
 
 
403 aa  82.4  1e-14  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.849888  hitchhiker  0.000145945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>