195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3126 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3126  PKD  100 
 
 
1162 aa  2308    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0241283  unclonable  0.0000395166 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0947  hypothetical protein  33.73 
 
 
730 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1526  hypothetical protein  33.14 
 
 
525 aa  132  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  27.73 
 
 
958 aa  96.3  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  35.98 
 
 
2554 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  53.41 
 
 
1969 aa  82  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  49.43 
 
 
910 aa  79.3  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  49.44 
 
 
940 aa  78.2  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  57.35 
 
 
963 aa  77.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  48.48 
 
 
2272 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  46.15 
 
 
1120 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  45.45 
 
 
859 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  46.15 
 
 
791 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  43.93 
 
 
1862 aa  77  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  53.52 
 
 
838 aa  76.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  47.25 
 
 
679 aa  76.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  39.23 
 
 
2122 aa  76.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  51.72 
 
 
978 aa  76.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  46.15 
 
 
658 aa  75.5  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  50.57 
 
 
2036 aa  75.5  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  44.58 
 
 
941 aa  75.1  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  44.68 
 
 
685 aa  75.1  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  46.15 
 
 
713 aa  74.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  46.15 
 
 
675 aa  74.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  36.75 
 
 
930 aa  74.3  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  47.57 
 
 
1682 aa  74.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  47.73 
 
 
581 aa  73.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  46.15 
 
 
669 aa  73.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  41.46 
 
 
615 aa  73.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  45.05 
 
 
1300 aa  73.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  45.54 
 
 
2000 aa  73.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  43.97 
 
 
1842 aa  72.4  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  48.19 
 
 
752 aa  72.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  53.33 
 
 
1667 aa  72.4  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  46.43 
 
 
1094 aa  72  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  46.15 
 
 
1882 aa  72  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  50.62 
 
 
575 aa  72  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  43.96 
 
 
551 aa  71.6  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  50.57 
 
 
861 aa  72  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  40.57 
 
 
1667 aa  71.6  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  44.58 
 
 
1732 aa  71.6  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  37.17 
 
 
547 aa  71.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  44.58 
 
 
3295 aa  71.6  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  44.58 
 
 
787 aa  70.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  46.59 
 
 
184 aa  71.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  46 
 
 
1236 aa  70.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
1356 aa  71.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  51.25 
 
 
1092 aa  70.1  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.43 
 
 
1158 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  47.78 
 
 
1361 aa  70.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  47.62 
 
 
500 aa  70.1  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  34.62 
 
 
560 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  39.83 
 
 
735 aa  70.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  45.78 
 
 
644 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  45.92 
 
 
918 aa  69.3  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  44.32 
 
 
561 aa  69.3  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2388  hypothetical protein  25.87 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  43.02 
 
 
1042 aa  68.9  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.53 
 
 
594 aa  68.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  53.73 
 
 
1528 aa  68.6  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  46.34 
 
 
1241 aa  68.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  46.91 
 
 
848 aa  67.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  42.86 
 
 
930 aa  67.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  35.34 
 
 
1231 aa  67.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2607  PKD  46.34 
 
 
235 aa  67.4  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.87 
 
 
1085 aa  67.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  43.88 
 
 
1387 aa  67  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  38.95 
 
 
211 aa  66.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  35.88 
 
 
929 aa  66.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  35.96 
 
 
869 aa  65.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  43.75 
 
 
2176 aa  65.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  44.09 
 
 
2552 aa  65.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  38.95 
 
 
684 aa  65.5  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  42.35 
 
 
719 aa  65.1  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  44.33 
 
 
1311 aa  65.1  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  47.06 
 
 
1328 aa  64.7  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  44.71 
 
 
519 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0853  hypothetical protein  31.34 
 
 
638 aa  64.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.46012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  35.34 
 
 
4433 aa  64.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  55.88 
 
 
1095 aa  64.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  42.31 
 
 
816 aa  64.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  43.18 
 
 
996 aa  64.3  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  41.24 
 
 
587 aa  63.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  46.51 
 
 
443 aa  62.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  47.44 
 
 
802 aa  63.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  45.68 
 
 
1282 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 
1380 aa  63.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  44.71 
 
 
1531 aa  63.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  48.81 
 
 
460 aa  62.8  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  48.19 
 
 
530 aa  62.8  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  47.95 
 
 
374 aa  62.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  34.03 
 
 
1620 aa  62  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  47.62 
 
 
845 aa  62  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  40.43 
 
 
952 aa  61.6  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  46.34 
 
 
1292 aa  62  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  41.3 
 
 
439 aa  61.6  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  41.38 
 
 
1189 aa  61.6  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  45.45 
 
 
1056 aa  60.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  50.67 
 
 
525 aa  61.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  49.35 
 
 
528 aa  60.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>