236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1666 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  100 
 
 
455 aa  935    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2835  hypothetical protein  68.46 
 
 
291 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07366  conserved hypothetical protein  53.51 
 
 
414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  43.07 
 
 
773 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  41.51 
 
 
486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  42.33 
 
 
633 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  41.33 
 
 
854 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  50.44 
 
 
609 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  42.96 
 
 
1128 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  44.76 
 
 
681 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  44.83 
 
 
743 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  39.04 
 
 
842 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  40.54 
 
 
491 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  41.67 
 
 
495 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  45.54 
 
 
812 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  43.09 
 
 
488 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  37.14 
 
 
767 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 
628 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  45.22 
 
 
846 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  40.54 
 
 
459 aa  97.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.79 
 
 
499 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  44.66 
 
 
364 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  41.67 
 
 
847 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  40 
 
 
913 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  46.74 
 
 
474 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.03 
 
 
479 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  46 
 
 
491 aa  94.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  38.05 
 
 
605 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.16 
 
 
681 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.95 
 
 
979 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  41.6 
 
 
446 aa  94  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  43.36 
 
 
785 aa  93.6  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  43.01 
 
 
448 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  45.19 
 
 
596 aa  93.2  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  42.02 
 
 
875 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.78 
 
 
984 aa  92.8  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  40.59 
 
 
543 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  41.35 
 
 
925 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.51 
 
 
469 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  45.98 
 
 
456 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  45.98 
 
 
422 aa  90.5  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  40.54 
 
 
589 aa  90.1  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  34.75 
 
 
864 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  43.96 
 
 
353 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  42.16 
 
 
688 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  41.18 
 
 
518 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  39.22 
 
 
778 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  38.74 
 
 
533 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  40.38 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  37.5 
 
 
774 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 
620 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  35.51 
 
 
746 aa  84  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  42.45 
 
 
719 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.89 
 
 
590 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  42.16 
 
 
978 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  38.83 
 
 
934 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  38.52 
 
 
963 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.23 
 
 
998 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  36.94 
 
 
525 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  42.27 
 
 
485 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  35.45 
 
 
851 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  35.19 
 
 
744 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  36.79 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  40.59 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  40.19 
 
 
894 aa  80.5  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  39.13 
 
 
829 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.14 
 
 
588 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  39.29 
 
 
942 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  38.83 
 
 
438 aa  79  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  35.51 
 
 
775 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  39.02 
 
 
372 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  38.24 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  37.23 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  35.64 
 
 
1055 aa  77.4  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  35.45 
 
 
669 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  36.19 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  34.95 
 
 
580 aa  77  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  34.35 
 
 
966 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  33.98 
 
 
974 aa  76.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  31.85 
 
 
894 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  36.63 
 
 
623 aa  76.6  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  32.67 
 
 
906 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  40 
 
 
694 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3215  glycoside hydrolase family 6  37.62 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  33.94 
 
 
679 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  36.63 
 
 
1007 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  34.51 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  36.27 
 
 
842 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  40.2 
 
 
935 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  34.95 
 
 
880 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  40.43 
 
 
938 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  38.64 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  37.74 
 
 
487 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  38.04 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  36.89 
 
 
400 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  41.35 
 
 
436 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  38.64 
 
 
347 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  36.54 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  38.3 
 
 
911 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  36.36 
 
 
468 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>