171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2758 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 396 aa  799    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  56.4 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  48.84 
 
 		 412 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  47.94 
 
 		 379 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  44.79 
 
 		 436 aa  312  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  39.56 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  34.3 
 
 		 368 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  32.44 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  31.85 
 
 		 372 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  30.67 
 
 		 365 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  31.61 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  29.87 
 
 		 343 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  32.52 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  30 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.4 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  30.27 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  28.3 
 
 		 361 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  30.91 
 
 		 668 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  30.96 
 
 		 355 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  29.36 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  29.89 
 
 		 831 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  32.66 
 
 		 930 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  24.42 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  30.47 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.93 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  32.38 
 
 		 676 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28.09 
 
 		 491 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  32.42 
 
 		 627 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  31.34 
 
 		 522 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  36.21 
 
 		 579 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  28.06 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.83 
 
 		 752 aa  93.2  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  33.66 
 
 		 390 aa  92.8  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  30.26 
 
 		 1293 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31.05 
 
 		 709 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  33.71 
 
 		 525 aa  90.5  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.36 
 
 		 387 aa  90.1  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  30.89 
 
 		 319 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.21 
 
 		 588 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  30.94 
 
 		 307 aa  86.3  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.91 
 
 		 1163 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.88 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  31.4 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  31.98 
 
 		 321 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1146 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.15 
 
 		 930 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  29.11 
 
 		 786 aa  77  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1030 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  27.23 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  30.41 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  24.35 
 
 		 700 aa  74.3  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  31.67 
 
 		 888 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  27.66 
 
 		 899 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1177 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  28.49 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  29.82 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  26.37 
 
 		 898 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  32.4 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  28.09 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  28.25 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 1230 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.45 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  26.25 
 
 		 318 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  26.78 
 
 		 1079 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  27.81 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  33.77 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  30.11 
 
 		 668 aa  64.7  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  26.32 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  32.23 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  30 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.43 
 
 		 1140 aa  63.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  30.77 
 
 		 1094 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  27 
 
 		 913 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  30.05 
 
 		 664 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  28.19 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  26.85 
 
 		 906 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  30.57 
 
 		 1834 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.86 
 
 		 1949 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1750 aa  60.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  25.59 
 
 		 684 aa  60.1  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1591  NHL repeat containing protein  25.67 
 
 		 686 aa  60.1  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.24269  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  31.41 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  25.55 
 
 		 680 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  33.1 
 
 		 711 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  28.65 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1030 aa  58.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  29.33 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1068 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1351 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  28.65 
 
 		 513 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  29.07 
 
 		 297 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  32.76 
 
 		 279 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  24.02 
 
 		 937 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 683 aa  53.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1763 aa  53.5  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 732 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  23.9 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  24.4 
 
 		 621 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  23.74 
 
 		 646 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.45 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>