118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3112 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 436 aa  884    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  44.67 
 
 		 412 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  42.36 
 
 		 396 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  42.09 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  41.07 
 
 		 379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  37.85 
 
 		 384 aa  246  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  32.64 
 
 		 353 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  26.3 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  25.91 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  28.65 
 
 		 355 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  30.31 
 
 		 343 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  26.93 
 
 		 347 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  28.77 
 
 		 343 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  25.47 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  28.81 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 668 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  24.6 
 
 		 361 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  26.28 
 
 		 372 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  30.88 
 
 		 1146 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.61 
 
 		 930 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.68 
 
 		 522 aa  94.4  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  32.54 
 
 		 676 aa  93.2  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  30.31 
 
 		 831 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30.09 
 
 		 752 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  30.19 
 
 		 1163 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  26.26 
 
 		 418 aa  90.1  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  28.86 
 
 		 346 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  25.84 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  26.92 
 
 		 491 aa  87  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.49 
 
 		 579 aa  86.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  27.78 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  28.29 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.06 
 
 		 588 aa  83.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.29 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30.54 
 
 		 627 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.65 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  28.47 
 
 		 1140 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.57 
 
 		 1030 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  26.73 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  26.27 
 
 		 709 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1177 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  28.86 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  23.53 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  29.82 
 
 		 390 aa  73.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  28.4 
 
 		 700 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  26.42 
 
 		 1293 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  28.04 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  29.1 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  28.42 
 
 		 930 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  29.76 
 
 		 684 aa  67.4  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28 
 
 		 1750 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  28.04 
 
 		 322 aa  67  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  28.72 
 
 		 373 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.52 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  28.91 
 
 		 786 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.9 
 
 		 1834 aa  60.5  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  28.48 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  26.4 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0291  NHL repeat-containing protein  28.48 
 
 		 669 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.71 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  28.75 
 
 		 668 aa  56.6  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  28.81 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 1230 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  25.46 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  23.55 
 
 		 850 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  27.57 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  27 
 
 		 888 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  25.23 
 
 		 898 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1026 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  25.9 
 
 		 899 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  23.58 
 
 		 639 aa  53.9  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  29.66 
 
 		 315 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  25.97 
 
 		 1079 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  26.55 
 
 		 646 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1949 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  22.75 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  26.64 
 
 		 805 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  29.91 
 
 		 211 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  26.85 
 
 		 2296 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  23.44 
 
 		 683 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1030 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  28.11 
 
 		 1763 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  22.87 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  27.96 
 
 		 841 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.42 
 
 		 1292 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.56 
 
 		 303 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  24.32 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  26.17 
 
 		 538 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.44 
 
 		 526 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0177  NHL repeat containing protein  29.21 
 
 		 716 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1051 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.73 
 
 		 334 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.7 
 
 		 693 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.35 
 
 		 305 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  34.18 
 
 		 521 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0496  NHL repeat-containing protein  26.92 
 
 		 937 aa  46.6  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  23.27 
 
 		 913 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 		 903 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  26.35 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>