186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2482 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 384 aa  796    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  74.52 
 
 		 393 aa  579  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  36.06 
 
 		 315 aa  199  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  33.61 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  31.65 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  31.56 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  32.13 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  30.81 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  29.36 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  28.69 
 
 		 330 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  28.53 
 
 		 348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  30.49 
 
 		 319 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  31.43 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  28.28 
 
 		 855 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  27.79 
 
 		 344 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 		 644 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  30.29 
 
 		 524 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.31 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  27.14 
 
 		 334 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  28.34 
 
 		 522 aa  93.2  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  26.04 
 
 		 313 aa  89.7  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.55 
 
 		 495 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  26.53 
 
 		 509 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  26.19 
 
 		 713 aa  87  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  25.61 
 
 		 524 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  27.68 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  27.39 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  28.76 
 
 		 533 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.86 
 
 		 607 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  24.43 
 
 		 527 aa  80.1  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  25.48 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  23.23 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  27.82 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  26.38 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3207  glycoside hydrolase family protein  25.85 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  26.9 
 
 		 468 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  29.59 
 
 		 1186 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.16 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  30.89 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  27.09 
 
 		 542 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.23 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  28.49 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  27.7 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2371  glycoside hydrolase family 43  23.91 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  24.66 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  28.26 
 
 		 618 aa  70.1  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  24.84 
 
 		 505 aa  69.3  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.99 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.44 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.77 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  24.07 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.25 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  26.3 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  24.03 
 
 		 464 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  23.94 
 
 		 829 aa  67  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  25.82 
 
 		 326 aa  67  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.62 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  24.93 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.49 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  66.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  31.64 
 
 		 712 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2329  glycoside hydrolase family 43  28.81 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000753035  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  23.55 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  24.71 
 
 		 550 aa  63.9  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  30.39 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.27 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  31.87 
 
 		 1338 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 		 315 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  25.86 
 
 		 315 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  25.33 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  23.8 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  25.7 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 		 572 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.59 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  25.24 
 
 		 581 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.27 
 
 		 577 aa  60.1  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 		 571 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  30.77 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.04 
 
 		 699 aa  59.7  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  22.97 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  23.14 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.77 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  25.59 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  24.76 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  28.31 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.56 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.56 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  28.49 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 		 665 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  23.75 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.1 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  27.92 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  23.49 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>