More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0666 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0666  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  40.13 
 
 
208 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0630  peptide deformylase  39.29 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231899  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  35.62 
 
 
169 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  37.91 
 
 
182 aa  92.8  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  38.93 
 
 
177 aa  92.4  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  39.84 
 
 
177 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  41.67 
 
 
178 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  39.84 
 
 
204 aa  88.6  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1151  peptide deformylase  36.75 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1173  peptide deformylase  36.75 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.960684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0678  peptide deformylase  35.37 
 
 
183 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  39.84 
 
 
177 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1895  peptide deformylase  34.32 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000101178  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  37.5 
 
 
177 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  32.53 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  39.84 
 
 
177 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  37.78 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  33.33 
 
 
177 aa  86.3  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  40.62 
 
 
174 aa  86.3  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  40.31 
 
 
179 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  38.76 
 
 
179 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  34.15 
 
 
185 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  39.39 
 
 
178 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  38.13 
 
 
190 aa  84.7  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  39.23 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  33.78 
 
 
170 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  31.9 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  38.64 
 
 
178 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  33.73 
 
 
185 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  38.06 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  32.91 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0620  peptide deformylase  34.67 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  36.92 
 
 
181 aa  84  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  33.33 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  35.06 
 
 
176 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  38.28 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  38.28 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  36.92 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  36.92 
 
 
178 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  37.78 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  37.04 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  37.78 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  36.72 
 
 
177 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  37.12 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  37.04 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  35.14 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  39.84 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  37.69 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  35.14 
 
 
154 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  33.16 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  32.4 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  36.11 
 
 
188 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  37.88 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  36.76 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  36.64 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0205  peptide deformylase  33.33 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  36.67 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  37.69 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  37.5 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  32.69 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  35 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  34.11 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  34.81 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  36 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  37.98 
 
 
201 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  35.66 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  37.12 
 
 
181 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  31.82 
 
 
189 aa  78.2  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  36.64 
 
 
171 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  36.72 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1831  peptide deformylase  33.73 
 
 
184 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  36.64 
 
 
171 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  36.36 
 
 
164 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  35.88 
 
 
167 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  36.15 
 
 
154 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  34.46 
 
 
173 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  33.82 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  35.77 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  35.77 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2676  peptide deformylase  33.93 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00123074  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0438  polypeptide deformylase  37.5 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  34.93 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  34.38 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  34.69 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  36.15 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1204  peptide deformylase  26.04 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  34.88 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0600  peptide deformylase  37.5 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  33.55 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  35.76 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  31.68 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  36.84 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  34.88 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  35.15 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  37.4 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  35.66 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  33.33 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  35.66 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  35.66 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>