More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0664 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  100 
 
 		 223 aa  440  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  59.9 
 
 		 211 aa  228  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  51.16 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  47.75 
 
 		 217 aa  194  8.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  52.17 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0620  peptide deformylase  54.36 
 
 		 245 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3103  peptide deformylase  54 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2193  peptide deformylase  49.3 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00150941  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  48.02 
 
 		 226 aa  154  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  44.2 
 
 		 208 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  44.15 
 
 		 191 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12740  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  47.62 
 
 		 240 aa  118  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.869353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  41.67 
 
 		 204 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  37.65 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  42.04 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  37.65 
 
 		 168 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  38.27 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  35.71 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  42.86 
 
 		 177 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  40.13 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  37.04 
 
 		 168 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  40.51 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  40.51 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  40.51 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  40.51 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  41.14 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  40.51 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  40.51 
 
 		 177 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  40.51 
 
 		 177 aa  99  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  39.35 
 
 		 177 aa  99  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  40.88 
 
 		 174 aa  98.6  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  36.88 
 
 		 177 aa  98.6  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  41.14 
 
 		 177 aa  98.2  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  40 
 
 		 179 aa  98.2  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  36.42 
 
 		 168 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  34.57 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  36.42 
 
 		 168 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  36.42 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  39.87 
 
 		 177 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  38.61 
 
 		 177 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  39.35 
 
 		 177 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  40.22 
 
 		 170 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  39.35 
 
 		 177 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  33.95 
 
 		 168 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  39.38 
 
 		 179 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  40.38 
 
 		 170 aa  94.4  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  38.71 
 
 		 177 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  39.35 
 
 		 177 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  41.03 
 
 		 171 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  41.29 
 
 		 178 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  38.12 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  36.08 
 
 		 177 aa  93.2  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0251  peptide deformylase  36.63 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.142586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4052  peptide deformylase  35.87 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000087086 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  36.94 
 
 		 179 aa  92.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  37.65 
 
 		 171 aa  92.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  38.65 
 
 		 170 aa  92.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  40.91 
 
 		 181 aa  92  6e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  36.42 
 
 		 177 aa  92  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  40.49 
 
 		 215 aa  92  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1326  hypothetical protein  39.13 
 
 		 188 aa  91.7  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.368395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  38.22 
 
 		 177 aa  91.3  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  36.21 
 
 		 187 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  38.12 
 
 		 179 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  36.21 
 
 		 187 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  40.91 
 
 		 179 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  38.37 
 
 		 182 aa  90.9  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  38.85 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  34.57 
 
 		 168 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  38.85 
 
 		 179 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  40.37 
 
 		 174 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  35.15 
 
 		 184 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  38.65 
 
 		 172 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  33.7 
 
 		 189 aa  90.1  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  35.19 
 
 		 176 aa  89.7  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  37.58 
 
 		 177 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  36.97 
 
 		 181 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  35.76 
 
 		 168 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0030  peptide deformylase  34.55 
 
 		 184 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  38.22 
 
 		 178 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  34.55 
 
 		 184 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  40.12 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  38.89 
 
 		 179 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  37.66 
 
 		 165 aa  88.6  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  37.65 
 
 		 173 aa  88.6  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  36.32 
 
 		 190 aa  88.2  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  40.34 
 
 		 197 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  37.04 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  39.05 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  37.11 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  43.95 
 
 		 164 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  38.2 
 
 		 167 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  38.22 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  37.36 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  41.4 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2579  peptide deformylase  40.12 
 
 		 169 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.231026  hitchhiker  0.00000660539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  37.27 
 
 		 181 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  37.58 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  40.38 
 
 		 179 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  36.57 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>