More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4247 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  100 
 
 		 179 aa  359  9e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  92.18 
 
 		 179 aa  333  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  80.45 
 
 		 178 aa  297  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  80.9 
 
 		 178 aa  295  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  79.78 
 
 		 178 aa  293  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  79.21 
 
 		 178 aa  291  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  78.77 
 
 		 179 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  77.65 
 
 		 179 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  79.89 
 
 		 179 aa  285  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  72.07 
 
 		 177 aa  256  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  69.83 
 
 		 177 aa  255  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  69.83 
 
 		 177 aa  253  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  68.93 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  68.72 
 
 		 177 aa  249  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  69.27 
 
 		 177 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  68.16 
 
 		 177 aa  248  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  65.92 
 
 		 177 aa  248  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  68.16 
 
 		 177 aa  248  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  68.16 
 
 		 177 aa  248  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  68.16 
 
 		 177 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  68.16 
 
 		 177 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  68.16 
 
 		 177 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  67.6 
 
 		 177 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  70.76 
 
 		 204 aa  246  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  68.16 
 
 		 177 aa  246  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  67.6 
 
 		 177 aa  246  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  66.48 
 
 		 177 aa  244  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  65.36 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  66.48 
 
 		 177 aa  240  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  68.16 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  66.48 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  66.27 
 
 		 171 aa  232  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  68.21 
 
 		 174 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  67.04 
 
 		 177 aa  230  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  67.04 
 
 		 177 aa  230  9e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  67.04 
 
 		 177 aa  230  9e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  65.92 
 
 		 177 aa  228  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  63.95 
 
 		 181 aa  227  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  65.92 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  65.36 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  65.36 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  64.8 
 
 		 177 aa  225  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  64.61 
 
 		 178 aa  224  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  67.2 
 
 		 186 aa  220  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  67.04 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  62.15 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  68.72 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  60.82 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  59.3 
 
 		 177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  60.89 
 
 		 179 aa  204  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  45.56 
 
 		 181 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  51.02 
 
 		 169 aa  151  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  46.24 
 
 		 207 aa  147  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  48.19 
 
 		 176 aa  138  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  41.67 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  39.87 
 
 		 181 aa  127  9.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  43.71 
 
 		 178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  41.56 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  41.18 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  39.24 
 
 		 172 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  40.65 
 
 		 172 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  44.27 
 
 		 182 aa  121  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  43.51 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  40.23 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  36.54 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  39.26 
 
 		 168 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  38.85 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  37.27 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.04 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  40.46 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  36 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  40.46 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  40 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  38.51 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  38.07 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  37.27 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  35.4 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  38.27 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.76 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.76 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  39.74 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  37.2 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  36.02 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  37.79 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  40.52 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  40.52 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  40.52 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  39.26 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  42 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  38.89 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  37.91 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  38.27 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  38.65 
 
 		 168 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  39.26 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  38.65 
 
 		 168 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  41.04 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  45.16 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  37.25 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  40.62 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>