More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0975 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  54.71 
 
 		 190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  58.68 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  56.73 
 
 		 181 aa  201  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  56.73 
 
 		 179 aa  200  8e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  54.34 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  55.21 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  53.76 
 
 		 182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  53.99 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  45.35 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  45.45 
 
 		 170 aa  140  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  43.98 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  46.15 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1062  polypeptide deformylase  43.11 
 
 		 181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3037  peptide deformylase  45.81 
 
 		 181 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308072  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0937  peptide deformylase  43.71 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000269089  normal  0.0932727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  42.86 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  48.09 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  48.09 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  48.09 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  48.09 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  42.58 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  41.56 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  42.58 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  39.61 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  38.27 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  40.26 
 
 		 177 aa  121  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  41.18 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  41.45 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  39.24 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  38.96 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  37.79 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  40.91 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  40.26 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  40.52 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  40.13 
 
 		 177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  40.13 
 
 		 177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  40.91 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  39.47 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  37.93 
 
 		 207 aa  117  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  40.91 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  39.74 
 
 		 204 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  40.26 
 
 		 177 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  39.47 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  39.47 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  39.47 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  40.13 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  38.82 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  39.47 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  39.47 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  40.13 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  40 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  36.36 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  39.74 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  41.25 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  40.52 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  35.85 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  38.96 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  37.42 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  41.22 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  43.79 
 
 		 154 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  40.65 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  38.46 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  40.52 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  41.06 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  40.65 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  37.82 
 
 		 178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  37.82 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  37.5 
 
 		 162 aa  108  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.43 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  37.65 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  36.59 
 
 		 201 aa  107  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  37.25 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  38.61 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  42.68 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  40.51 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  40.49 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  37.28 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  35.58 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  41.06 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  39.74 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  40.26 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36.54 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  38.69 
 
 		 201 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  39.02 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  37.91 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  38.06 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  37.27 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  38.46 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  35.76 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  39.2 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  36.57 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  36.57 
 
 		 169 aa  104  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1128  peptide deformylase  38.92 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000081593  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  40.13 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  38.55 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  39.74 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  34.76 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0179  peptide deformylase  36.97 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.340419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  39.74 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>