More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1044 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  100 
 
 		 169 aa  340  7e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  56.55 
 
 		 207 aa  183  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  57.76 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  54.49 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  53.55 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  51.88 
 
 		 177 aa  163  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  52.17 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  51.55 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  51.2 
 
 		 177 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  51.2 
 
 		 177 aa  160  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  50.6 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  50.6 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  50.6 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  50.6 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  50.6 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  50.6 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  52.7 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  48.8 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  51.59 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  48.8 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  49.69 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  54.37 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  50 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  48.45 
 
 		 177 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  52.56 
 
 		 186 aa  154  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  51.25 
 
 		 179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  51.61 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  48.45 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  50.32 
 
 		 177 aa  154  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  48.43 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  51.02 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  48.39 
 
 		 204 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  51.97 
 
 		 179 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  51.68 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  48.77 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  50.61 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  50.61 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  51.01 
 
 		 174 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  50.94 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  48.21 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  47.31 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  49.69 
 
 		 177 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  49.69 
 
 		 177 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  49.69 
 
 		 177 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  49.07 
 
 		 177 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  48.32 
 
 		 178 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  47.68 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  48.45 
 
 		 177 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  47.65 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  46.43 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  48.8 
 
 		 178 aa  137  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  45.06 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  48.21 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  45.4 
 
 		 186 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  48.48 
 
 		 200 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  38.27 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  41.98 
 
 		 176 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  41.86 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  39.88 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  36.91 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  37.58 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  37.35 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  36.36 
 
 		 181 aa  111  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  38.93 
 
 		 178 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  38.93 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  36.54 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  41.84 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  38.89 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  38.36 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  43.33 
 
 		 181 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  41.55 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  41.88 
 
 		 204 aa  104  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  40.74 
 
 		 152 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  38.92 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  37.93 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  44.29 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  39.86 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  45.19 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  44.29 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  38.69 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  41.36 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  41.56 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0222  peptide deformylase  41.04 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  45.32 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  44.83 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  40.97 
 
 		 154 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  46 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0201  peptide deformylase  39.55 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1477  peptide deformylase  40.46 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0184  peptide deformylase  39.55 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.55747  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  38.82 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  38.57 
 
 		 167 aa  99  3e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  39.72 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  39.72 
 
 		 168 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  41.84 
 
 		 147 aa  97.8  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  42.11 
 
 		 190 aa  97.4  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3693  peptide deformylase  37.89 
 
 		 175 aa  97.4  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  43.15 
 
 		 195 aa  97.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3064  peptide deformylase  41.18 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  37.13 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>