More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5067 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  73.96 
 
 		 176 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  71.1 
 
 		 181 aa  263  7e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  63.95 
 
 		 190 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  64.5 
 
 		 177 aa  233  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  61.9 
 
 		 178 aa  218  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  61.31 
 
 		 178 aa  217  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  57.06 
 
 		 182 aa  207  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  56.73 
 
 		 182 aa  200  8e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3433  peptide deformylase  49.71 
 
 		 188 aa  173  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  51.28 
 
 		 185 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  50.64 
 
 		 185 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  50 
 
 		 176 aa  158  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  50.64 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  50 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3037  peptide deformylase  48.68 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308072  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0937  peptide deformylase  48.68 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000269089  normal  0.0932727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  49.34 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2912  peptide deformylase  47.1 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  47.93 
 
 		 170 aa  151  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1062  polypeptide deformylase  45.98 
 
 		 181 aa  150  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0639  peptide deformylase  51.32 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000242683  normal  0.990188 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  42.86 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  42.33 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  41.83 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  40.23 
 
 		 181 aa  127  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  40.52 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  42.48 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  41.18 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  40.4 
 
 		 177 aa  124  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  43.87 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  40.52 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  40.74 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  40.74 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  39.87 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  42.14 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  40.91 
 
 		 179 aa  121  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  40.51 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  38.16 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  38.41 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  38.31 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  39.07 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  39.07 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  39.87 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  37.91 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  37.09 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  37.09 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  37.09 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  38.85 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  37.09 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  37.09 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  40.37 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  36.05 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  36.42 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  37.09 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  40.65 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  39.47 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  38.15 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  36.42 
 
 		 177 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  36.42 
 
 		 177 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  40.65 
 
 		 178 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  37.71 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  39.61 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  39.61 
 
 		 179 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  38.41 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  40.26 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  35.84 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  38.46 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  40.59 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  38.56 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  38.24 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  37.91 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  37.35 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  37.41 
 
 		 165 aa  111  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  38.56 
 
 		 169 aa  111  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  39.87 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  39.61 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  40.52 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  41.56 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  40.4 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  43.79 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  37.13 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  37.29 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  38.36 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  38.65 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  40.26 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  37.09 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  37.09 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  37.09 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  37.5 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  36.53 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  36.42 
 
 		 177 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  39.22 
 
 		 179 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  40.26 
 
 		 179 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  36.42 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1571  peptide deformylase  37.11 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704863 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  36.48 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  40.94 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  37.65 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  36.57 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>