More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1440 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  100 
 
 
153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  51.02 
 
 
154 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  51.03 
 
 
154 aa  140  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  42.31 
 
 
201 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  44.23 
 
 
201 aa  134  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  47.86 
 
 
166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  52.45 
 
 
147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  50 
 
 
164 aa  133  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  48.57 
 
 
170 aa  133  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  42.68 
 
 
201 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  44.37 
 
 
164 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  42.95 
 
 
201 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  52.45 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  43.59 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  48.95 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  45.21 
 
 
150 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  45.81 
 
 
158 aa  131  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  41.67 
 
 
187 aa  130  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  42.95 
 
 
203 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  48.59 
 
 
164 aa  130  9e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  42.95 
 
 
187 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  42.95 
 
 
187 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  47.59 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  46.26 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  46.21 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  42.31 
 
 
201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  46.76 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  45.03 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  47.59 
 
 
169 aa  127  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  46.85 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  48.97 
 
 
178 aa  127  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  40.38 
 
 
202 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  44.06 
 
 
155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  46.85 
 
 
169 aa  127  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  39.74 
 
 
202 aa  126  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  45.14 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  46.45 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  40.38 
 
 
201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  46.94 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  44.52 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  44.44 
 
 
178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  44.52 
 
 
167 aa  124  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  48.3 
 
 
171 aa  123  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0808  peptide deformylase  41.67 
 
 
187 aa  123  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  44.76 
 
 
167 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  40.38 
 
 
201 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  46.21 
 
 
170 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  44.76 
 
 
167 aa  122  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  42.47 
 
 
192 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  47.26 
 
 
156 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2533  peptide deformylase  42.47 
 
 
188 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  42.95 
 
 
173 aa  122  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  48.87 
 
 
175 aa  121  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  42.28 
 
 
188 aa  120  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  45.71 
 
 
180 aa  120  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  45.1 
 
 
156 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  44.93 
 
 
170 aa  120  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  45.1 
 
 
156 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  45.1 
 
 
156 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  42.04 
 
 
189 aa  120  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  42.28 
 
 
190 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0147  peptide deformylase  45.89 
 
 
170 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.48044  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  44.44 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  44.44 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  44.44 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  45.19 
 
 
169 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  44.44 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  43.56 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  44.52 
 
 
158 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  41.3 
 
 
181 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  43.66 
 
 
180 aa  118  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  42.28 
 
 
172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  41.45 
 
 
162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  45 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  42.47 
 
 
185 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  42.31 
 
 
187 aa  117  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  40.26 
 
 
183 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  41.78 
 
 
185 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  47.55 
 
 
178 aa  116  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  39.6 
 
 
188 aa  116  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  40.79 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  42.47 
 
 
185 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  41.5 
 
 
185 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  44.2 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  43.57 
 
 
177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  38.75 
 
 
190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  46.26 
 
 
182 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  45.39 
 
 
177 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2039  peptide deformylase  43.24 
 
 
184 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  41.5 
 
 
172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0488  peptide deformylase  40.27 
 
 
199 aa  114  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  39.72 
 
 
188 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0018  peptide deformylase  44 
 
 
171 aa  114  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  42.55 
 
 
172 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  44.06 
 
 
156 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0868  peptide deformylase  42.14 
 
 
180 aa  113  8.999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.184037 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  45.52 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  42.66 
 
 
191 aa  112  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  39.26 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  42.66 
 
 
166 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>