More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1885 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  84.75 
 
 		 177 aa  318  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  83.05 
 
 		 177 aa  307  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  83.05 
 
 		 177 aa  307  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  82.49 
 
 		 177 aa  303  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  72.32 
 
 		 177 aa  270  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  72.32 
 
 		 177 aa  269  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  73.71 
 
 		 177 aa  268  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  71.19 
 
 		 177 aa  266  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  71.75 
 
 		 177 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  70.62 
 
 		 177 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  70.62 
 
 		 177 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  70.62 
 
 		 177 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  70.62 
 
 		 177 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  70.62 
 
 		 177 aa  264  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  71.75 
 
 		 177 aa  263  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  70.06 
 
 		 177 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  70.06 
 
 		 177 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  71.75 
 
 		 177 aa  262  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  72.88 
 
 		 177 aa  253  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  72.32 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  72.88 
 
 		 177 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  72.88 
 
 		 177 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  72.88 
 
 		 177 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  70 
 
 		 174 aa  250  7e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  68.72 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  67.86 
 
 		 177 aa  248  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  67.8 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  67.6 
 
 		 179 aa  246  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  73.3 
 
 		 178 aa  245  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  67.8 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  70.06 
 
 		 179 aa  243  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  70.06 
 
 		 179 aa  243  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  66.29 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  66.86 
 
 		 204 aa  236  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  63.69 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  65.36 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  62.36 
 
 		 178 aa  233  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  64.04 
 
 		 178 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  63.95 
 
 		 181 aa  232  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  65.48 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  63.48 
 
 		 178 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  62.36 
 
 		 178 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  61.45 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  64.97 
 
 		 186 aa  226  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  66.67 
 
 		 200 aa  225  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  68.93 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  63.84 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  65.76 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  58.08 
 
 		 171 aa  204  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  52.44 
 
 		 181 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  52.63 
 
 		 207 aa  171  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  50 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  47.56 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  42 
 
 		 190 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  42.77 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  40.88 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  40.52 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  40.85 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  43.24 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  41.5 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  38.56 
 
 		 181 aa  118  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  37.91 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  44.14 
 
 		 181 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3241  peptide deformylase  41.67 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00399502  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  37.91 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  43.71 
 
 		 178 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  38.96 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  38.22 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  41.06 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  42.76 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  39.88 
 
 		 208 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  43.71 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  42.76 
 
 		 185 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3599  peptide deformylase  42.11 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000726362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  40.12 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  42.11 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  41.22 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  42.95 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3037  peptide deformylase  43.45 
 
 		 181 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308072  normal  0.575591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  42.31 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0937  peptide deformylase  43.45 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000269089  normal  0.0932727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  40.67 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  40.67 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  40.67 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0857  peptide deformylase  40.94 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000415124  normal  0.708888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  40.67 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  43.92 
 
 		 227 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  40.54 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  40.76 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  42 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0900  peptide deformylase  42.76 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000606626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  40.96 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  41.88 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  41.33 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  43.33 
 
 		 168 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  39.33 
 
 		 168 aa  101  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  40 
 
 		 192 aa  100  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  40.52 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>