More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1279 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  74.03 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  73.08 
 
 		 182 aa  266  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  70.33 
 
 		 188 aa  257  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  71.43 
 
 		 182 aa  251  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  69.66 
 
 		 181 aa  247  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  60.67 
 
 		 183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  63.69 
 
 		 181 aa  231  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  65.36 
 
 		 186 aa  231  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  64.2 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  66.11 
 
 		 181 aa  221  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  62.09 
 
 		 183 aa  221  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  60.74 
 
 		 168 aa  203  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  56.44 
 
 		 167 aa  197  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  58.54 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  60.38 
 
 		 161 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  58.9 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  52.49 
 
 		 204 aa  191  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  56.17 
 
 		 166 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  53.8 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  54.32 
 
 		 180 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  62.15 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  53.42 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  55 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  54.37 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  52.2 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  56.95 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  48.75 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  49.07 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  50.29 
 
 		 195 aa  157  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  43.18 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  51.97 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  54.79 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  44.94 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  46.24 
 
 		 190 aa  151  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  48.55 
 
 		 183 aa  151  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  50.31 
 
 		 162 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  49.39 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  46.99 
 
 		 197 aa  144  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  47.53 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  42.46 
 
 		 192 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  50.96 
 
 		 213 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  45.45 
 
 		 190 aa  141  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  46.11 
 
 		 197 aa  140  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  45.91 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  45.91 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  51.59 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  51.5 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  47.31 
 
 		 230 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  46.11 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  46.75 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  49.03 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  45.56 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  45.56 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  45.56 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  47.85 
 
 		 221 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  45.45 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  48.43 
 
 		 167 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  45.91 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  46.9 
 
 		 156 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  47.56 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  48.37 
 
 		 177 aa  130  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  45.73 
 
 		 225 aa  130  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  48.8 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  48.98 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  46.26 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  47.95 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  39.38 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  43.05 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  48.99 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  47.44 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  44.44 
 
 		 147 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  46.53 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  42.42 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  42.67 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  43.14 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  41.71 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  45.68 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  43.75 
 
 		 147 aa  124  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  43.05 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  41.36 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  40.78 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  47.26 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  45.95 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  43.14 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  40.35 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  44.59 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  43.98 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  43.98 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  48.63 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  48.63 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  42.7 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  48.63 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  43.75 
 
 		 155 aa  121  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  45.03 
 
 		 219 aa  120  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  43.06 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1598  peptide deformylase  43.98 
 
 		 171 aa  120  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.24157  normal  0.0664949 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  42.86 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  42.66 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  48.34 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>