More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_19041 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  100 
 
 		 181 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  53.71 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  52.07 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  53.01 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  53.01 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  53.66 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  54.27 
 
 		 177 aa  183  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  53.66 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  54.22 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  51.2 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  51.83 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  51.22 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  49.7 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  50.6 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  51.22 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  50 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  52.44 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  50.88 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  49.39 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4855  peptide deformylase  52.07 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3102  peptide deformylase  50.89 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0798593  normal  0.280796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  51.22 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  52.41 
 
 		 174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  48.78 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  48.78 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  48.78 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  48.78 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  48.78 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  51.2 
 
 		 204 aa  171  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  48.17 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  48.17 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  47.19 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  46.07 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  49.4 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2202  peptide deformylase  49.43 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.113404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  45.56 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  48.48 
 
 		 179 aa  158  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  49.1 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  47.9 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  47.19 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1883  peptide deformylase  50.6 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0735735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  49.1 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  46.67 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  49.1 
 
 		 178 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  47.19 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  48.52 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2043  peptide deformylase  45.51 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6054  peptide deformylase  45.51 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0930556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2023  peptide deformylase  45.51 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  46.75 
 
 		 179 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  44.69 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  43.56 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  45.06 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  45.88 
 
 		 178 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  42.53 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  40.23 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5353  peptide deformylase  43.59 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  41.11 
 
 		 176 aa  124  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  38.79 
 
 		 181 aa  122  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  42.76 
 
 		 182 aa  121  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  42.41 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5060  peptide deformylase  38.85 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239364 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  40.12 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  40.52 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  38.95 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  38.42 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  42.24 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  39.74 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4446  peptide deformylase  37.5 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  36.99 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4508  peptide deformylase  37.5 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  38.75 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  40.25 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  39.16 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  39.62 
 
 		 154 aa  104  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  36.59 
 
 		 158 aa  104  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  36.42 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  41.51 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2201  peptide deformylase  38.31 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  39.1 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  40.88 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0906  peptide deformylase  39.74 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000931901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  39.49 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  39.74 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  37.2 
 
 		 274 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  38.22 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  33.13 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  38.22 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  40.51 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3476  peptide deformylase  38.41 
 
 		 185 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00071133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0038  peptide deformylase  39.62 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3013  peptide deformylase  37.09 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000829932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1885  polypeptide deformylase  37.82 
 
 		 155 aa  99.4  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.366875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0886  peptide deformylase  38.41 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000428038  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  43.4 
 
 		 180 aa  98.6  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  39.87 
 
 		 155 aa  98.6  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  39.49 
 
 		 168 aa  97.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  37.06 
 
 		 168 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1604  polypeptide deformylase  37.18 
 
 		 155 aa  97.1  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000418701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3401  peptide deformylase  37.75 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000135447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>