More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_35850 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_35850  Peptide deformylase, mitochondrial  100 
 
 		 274 aa  539  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3916  peptide deformylase  46.2 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.511454  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2193  peptide deformylase  45.56 
 
 		 226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00150941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  45.51 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2610  Peptide deformylase  44.22 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29330  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  42.33 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1935  peptide deformylase  44.91 
 
 		 226 aa  119  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000939667 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1147  peptide deformylase  42.08 
 
 		 217 aa  116  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  38.92 
 
 		 204 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  37.57 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0620  peptide deformylase  42.31 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  37.91 
 
 		 177 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0944  peptide deformylase  38.86 
 
 		 217 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  37.36 
 
 		 177 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2068  peptide deformylase  36.36 
 
 		 207 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000124713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  36.14 
 
 		 177 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  35.71 
 
 		 181 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3103  peptide deformylase  44.44 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0664  Peptide deformylase  35.71 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.106067  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  36.96 
 
 		 177 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  36.36 
 
 		 177 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  36.59 
 
 		 177 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  36.41 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  40.12 
 
 		 190 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1598  polypeptide deformylase  35.98 
 
 		 179 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.331513  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  36.97 
 
 		 181 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  35.87 
 
 		 177 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  38.55 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  36.59 
 
 		 179 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  38.24 
 
 		 190 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  37.2 
 
 		 179 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4349  peptide deformylase  35.98 
 
 		 179 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  38 
 
 		 170 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  37.97 
 
 		 189 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3859  peptide deformylase  38.18 
 
 		 178 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02433  peptide deformylase  36.14 
 
 		 171 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2948  peptide deformylase  37.02 
 
 		 179 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1044  peptide deformylase  39.1 
 
 		 169 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  35.12 
 
 		 177 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3780  peptide deformylase  34.57 
 
 		 179 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.873393  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  35.19 
 
 		 172 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  35.8 
 
 		 177 aa  93.2  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  34.52 
 
 		 177 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  35.71 
 
 		 178 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  35.19 
 
 		 172 aa  92  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4559  peptide deformylase  36.36 
 
 		 178 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.865436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  35.03 
 
 		 183 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  36.59 
 
 		 177 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  36.59 
 
 		 177 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  36.59 
 
 		 177 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  34.81 
 
 		 177 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  36.59 
 
 		 177 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  36.59 
 
 		 177 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  36.9 
 
 		 177 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  35.98 
 
 		 177 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4066  peptide deformylase  35.76 
 
 		 178 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  35.98 
 
 		 177 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  34.32 
 
 		 179 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  37.85 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  33.33 
 
 		 201 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  33.14 
 
 		 182 aa  90.5  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  33.33 
 
 		 201 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  40.12 
 
 		 169 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  35.5 
 
 		 174 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1818  peptide deformylase  33.15 
 
 		 179 aa  89.4  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2295  peptide deformylase  35.71 
 
 		 179 aa  89.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.758676  normal  0.0432981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1579  peptide deformylase  35.71 
 
 		 179 aa  89.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2840  peptide deformylase  39.53 
 
 		 170 aa  89.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  35.56 
 
 		 190 aa  89  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3612  peptide deformylase  35.8 
 
 		 186 aa  88.6  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  33.53 
 
 		 168 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  36.97 
 
 		 181 aa  88.6  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00771  peptide deformylase  31.82 
 
 		 203 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0342378  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  34.91 
 
 		 177 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  32.16 
 
 		 168 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  33.74 
 
 		 168 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  34.39 
 
 		 187 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  34.39 
 
 		 187 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  33.94 
 
 		 190 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  36.81 
 
 		 154 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  34.15 
 
 		 196 aa  87.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1253  peptide deformylase  36.31 
 
 		 177 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00990122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  33.9 
 
 		 178 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  33.94 
 
 		 164 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12740  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  40 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.869353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  30.98 
 
 		 201 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  32.94 
 
 		 168 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3323  peptide deformylase  32 
 
 		 182 aa  87  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  33.74 
 
 		 168 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  33.74 
 
 		 168 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  39.38 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  34.36 
 
 		 168 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2031  peptide deformylase  36.62 
 
 		 166 aa  86.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0011  peptide deformylase  34.76 
 
 		 172 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.196831  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  32.35 
 
 		 168 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  36.97 
 
 		 176 aa  85.9  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  34.3 
 
 		 177 aa  85.5  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  31.98 
 
 		 189 aa  85.5  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  39.71 
 
 		 171 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  39.29 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>