More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_09550 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  56.32 
 
 
190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  57.37 
 
 
190 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  49.21 
 
 
190 aa  174  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  45.88 
 
 
195 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  45.27 
 
 
215 aa  167  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  46.96 
 
 
183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  45.18 
 
 
197 aa  161  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  45.18 
 
 
198 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  45.69 
 
 
197 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  45.69 
 
 
197 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  45.69 
 
 
197 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  43.65 
 
 
197 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  48.24 
 
 
200 aa  156  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  44.16 
 
 
197 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  46.71 
 
 
213 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  43.86 
 
 
182 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  47.85 
 
 
185 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  42.77 
 
 
199 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  44.51 
 
 
192 aa  128  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  44.05 
 
 
183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  47.17 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  41.14 
 
 
188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  44.23 
 
 
188 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  42.26 
 
 
162 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  41.18 
 
 
162 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  42.26 
 
 
204 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  44.44 
 
 
221 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  45.24 
 
 
219 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  41.57 
 
 
230 aa  122  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  40.32 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  40.48 
 
 
163 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  41.28 
 
 
164 aa  118  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  40.48 
 
 
162 aa  118  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  47.68 
 
 
164 aa  118  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  38.69 
 
 
181 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  39.05 
 
 
162 aa  116  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  36.79 
 
 
186 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  39.88 
 
 
180 aa  115  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  44.77 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  39.16 
 
 
173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  36.96 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  39.08 
 
 
172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  35.75 
 
 
186 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  41.04 
 
 
178 aa  111  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0042  peptide deformylase  39.76 
 
 
176 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  37.5 
 
 
181 aa  111  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  37.16 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  43.95 
 
 
191 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  37.21 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  41.67 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  41.28 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  41.06 
 
 
164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  37.13 
 
 
167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.79 
 
 
168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  37.87 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  37.87 
 
 
166 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  39.39 
 
 
168 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  36.61 
 
 
177 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  40.12 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  40.12 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  40 
 
 
168 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  37.28 
 
 
164 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  39.05 
 
 
180 aa  108  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  37.93 
 
 
168 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  40.12 
 
 
168 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  38.79 
 
 
168 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  37.5 
 
 
182 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  36.76 
 
 
185 aa  106  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  37.93 
 
 
168 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  39.77 
 
 
167 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  38.79 
 
 
168 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  40.4 
 
 
164 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  38.98 
 
 
170 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  39.55 
 
 
168 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  38.98 
 
 
170 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  43.75 
 
 
162 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  40.8 
 
 
169 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  38.18 
 
 
181 aa  105  6e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  37.36 
 
 
168 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  36.31 
 
 
184 aa  104  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  37.5 
 
 
161 aa  104  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  37.87 
 
 
167 aa  104  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  37.25 
 
 
153 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  39.02 
 
 
167 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  35.12 
 
 
162 aa  103  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1918  peptide deformylase  35.47 
 
 
171 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.101143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1636  peptide deformylase  35.47 
 
 
171 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0693  peptide deformylase  38.1 
 
 
184 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  39.43 
 
 
169 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  38.69 
 
 
182 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  37.5 
 
 
190 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  40.12 
 
 
170 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  36.53 
 
 
182 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  34.03 
 
 
189 aa  102  4e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  35.33 
 
 
171 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  36.9 
 
 
162 aa  102  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  38.95 
 
 
167 aa  101  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  37.31 
 
 
181 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  37.21 
 
 
172 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>