More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1367 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  100 
 
 		 182 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  84.07 
 
 		 182 aa  300  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  77.47 
 
 		 181 aa  294  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  74.18 
 
 		 180 aa  280  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  74.86 
 
 		 181 aa  271  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  68.31 
 
 		 188 aa  265  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  65.73 
 
 		 186 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  67.4 
 
 		 181 aa  237  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  60.34 
 
 		 181 aa  237  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  64.77 
 
 		 186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  63.69 
 
 		 183 aa  231  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  61.54 
 
 		 183 aa  230  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  57.67 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  59.12 
 
 		 161 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  59.15 
 
 		 168 aa  194  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  56.1 
 
 		 167 aa  193  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  53.61 
 
 		 204 aa  189  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  54.32 
 
 		 166 aa  188  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  53.01 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  55.83 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  61.02 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  52.47 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  53.42 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  53.75 
 
 		 162 aa  177  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  54.04 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  50.31 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  52.8 
 
 		 164 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  50.97 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  49.03 
 
 		 162 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  48.45 
 
 		 162 aa  157  9e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  49.16 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  52.98 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  41.67 
 
 		 230 aa  150  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  47.09 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  45.57 
 
 		 162 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  51.37 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  46.29 
 
 		 190 aa  144  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  53.01 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  44.52 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  45.95 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  45.41 
 
 		 197 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  45.41 
 
 		 197 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  45.41 
 
 		 197 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  44.79 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  43.1 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  46.34 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  46.55 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  46.06 
 
 		 225 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  47.62 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  43.89 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  44.38 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  44.38 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  43.24 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  47.26 
 
 		 156 aa  131  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  47.13 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  45.03 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  47.22 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  46.9 
 
 		 155 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  46.79 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  43.79 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  44.97 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  44.38 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  44.9 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  42.77 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  46.41 
 
 		 185 aa  124  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  41.92 
 
 		 230 aa  123  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  42.86 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  41.34 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  40.76 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  45.22 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  38.12 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  43.23 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  43.75 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  43.06 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  39.51 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  42.86 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  44.38 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  43.92 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  43.42 
 
 		 167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  43.92 
 
 		 156 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  43.64 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  43.92 
 
 		 156 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  41.9 
 
 		 198 aa  117  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  41.45 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  41.67 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  43.84 
 
 		 151 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  41.01 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  43.24 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  43.24 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  35.68 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  43.24 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  43.24 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  44 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  40.37 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  43.24 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  42.33 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  35.98 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  36.57 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  41.67 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  36.57 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>