More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27860 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  100 
 
 		 166 aa  339  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  66.87 
 
 		 184 aa  226  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  65.24 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  61.01 
 
 		 162 aa  196  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  61.25 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  58.13 
 
 		 164 aa  191  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  59.01 
 
 		 162 aa  191  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  56.17 
 
 		 180 aa  189  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  53.37 
 
 		 181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  58.49 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  56.25 
 
 		 162 aa  186  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  54.32 
 
 		 182 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  52.15 
 
 		 183 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  53.89 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  53.37 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  50.92 
 
 		 186 aa  177  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  55 
 
 		 162 aa  177  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  55.21 
 
 		 182 aa  177  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  49.69 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  53.12 
 
 		 162 aa  174  5e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  52.76 
 
 		 188 aa  172  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  50.31 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  51.53 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  52.44 
 
 		 181 aa  167  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  47.53 
 
 		 204 aa  158  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  51.88 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  50.92 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  47.53 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  41.72 
 
 		 180 aa  144  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  49.32 
 
 		 191 aa  140  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  44.3 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  54.11 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  44.65 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  44.65 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  47.2 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  42.86 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  46.54 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  40.98 
 
 		 230 aa  131  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  46.58 
 
 		 178 aa  130  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  41.86 
 
 		 183 aa  127  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  44.94 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  43.02 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  41.18 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  41.67 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  43.35 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  39.66 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  42.11 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  45.73 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  41.45 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  40.79 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  40.54 
 
 		 164 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  36.81 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  34.59 
 
 		 169 aa  119  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  43.23 
 
 		 227 aa  117  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  46.15 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  41.46 
 
 		 200 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  39.19 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.14 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  35.33 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  39.77 
 
 		 215 aa  114  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  41.88 
 
 		 199 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  39.31 
 
 		 190 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1319  peptide deformylase  37.5 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  41.1 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  38.55 
 
 		 197 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  41.18 
 
 		 188 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  38.86 
 
 		 230 aa  111  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  40.37 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  39.58 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  40.65 
 
 		 170 aa  110  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  38.55 
 
 		 197 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  38.55 
 
 		 197 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  38.55 
 
 		 197 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  37.87 
 
 		 213 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  39.11 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  40.76 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  39.05 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  39.35 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  43.23 
 
 		 221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  38.62 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  46.27 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  40.67 
 
 		 172 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  37.67 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3726  peptide deformylase  41.77 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  37.5 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  38.04 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  37.04 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  37.43 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  37.5 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  40.88 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  38.1 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  39.35 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  41.67 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0454  peptide deformylase  39.58 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  39.35 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  40.12 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  36.05 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  36.6 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  37.5 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  38.2 
 
 		 198 aa  104  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>