More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0295 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  68.85 
 
 		 185 aa  258  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  66.87 
 
 		 166 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  65.82 
 
 		 161 aa  208  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  64.15 
 
 		 162 aa  205  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  62.66 
 
 		 164 aa  205  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  62.89 
 
 		 162 aa  201  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  61.49 
 
 		 162 aa  197  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  60.25 
 
 		 162 aa  197  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  58.9 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  53.99 
 
 		 181 aa  187  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  56.44 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  53.37 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  58.23 
 
 		 162 aa  182  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  50.89 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  55.62 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  54.82 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  50.89 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  54.88 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  53.37 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  54.94 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  49.69 
 
 		 183 aa  171  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  54.32 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  55.21 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  46.82 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  47.24 
 
 		 180 aa  157  7e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  49.69 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  46.77 
 
 		 204 aa  154  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  47.62 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  48.8 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  46.99 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  49.69 
 
 		 197 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  45.26 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  54.66 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  51.37 
 
 		 191 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  43.43 
 
 		 192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  49.07 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  43.67 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  41.84 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  41.84 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  50 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  40.82 
 
 		 197 aa  131  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  44.67 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  50.62 
 
 		 177 aa  131  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  43.52 
 
 		 198 aa  130  9e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  42.86 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  42.86 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  42.86 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  46.15 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  41.18 
 
 		 230 aa  127  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  44.24 
 
 		 200 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  39.68 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  41.82 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  41.77 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  42.05 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  38.62 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  43.75 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  40.34 
 
 		 199 aa  117  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  42.41 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  46.84 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  40 
 
 		 227 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  44.3 
 
 		 167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  36.63 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  36.95 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  40 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  44.97 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  39.16 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  40.4 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  41.76 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  41.1 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  36.75 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  40.85 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  32.67 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  36.05 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  36.69 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  40 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  40.65 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  41.94 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  45.19 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  37.2 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  38.06 
 
 		 164 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  36.31 
 
 		 213 aa  104  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  36.14 
 
 		 171 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1128  peptide deformylase  37.29 
 
 		 196 aa  104  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  35.93 
 
 		 170 aa  104  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  37.95 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  41.89 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3860  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  37.42 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  33.33 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  34.5 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  34.5 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  33.33 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0394  peptide deformylase  37.58 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  40.51 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  38.55 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  36.75 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  37.5 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  37.35 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>