More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0562 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  100 
 
 		 185 aa  364  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  60.69 
 
 		 200 aa  188  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  60.23 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  58.93 
 
 		 213 aa  178  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  59.17 
 
 		 182 aa  177  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  55.49 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  53.05 
 
 		 199 aa  157  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  53.05 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  55.48 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  52.49 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  51.83 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  52.44 
 
 		 219 aa  148  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  53.74 
 
 		 195 aa  147  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  48.21 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  54.97 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  51.22 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  49.34 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  51.85 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  49.08 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  47.85 
 
 		 213 aa  135  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  47.56 
 
 		 190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  50.62 
 
 		 197 aa  134  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  51.61 
 
 		 197 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  51.22 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  50 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  49.09 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  48.8 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  46.15 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  45.18 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  54.32 
 
 		 178 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  45.62 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  48.03 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  48.48 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  44.81 
 
 		 162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  46.75 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  46.75 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  46.75 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  42.31 
 
 		 162 aa  124  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  44.08 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  43.4 
 
 		 181 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  48.05 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  45.73 
 
 		 166 aa  121  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  50 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  48.75 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  51.7 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  46.1 
 
 		 162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  42.26 
 
 		 181 aa  117  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  48.47 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  44.52 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  43.12 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  41.72 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  43.12 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  43.79 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  45.1 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  46.41 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  45.96 
 
 		 161 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  44.52 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  41.72 
 
 		 167 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  41.72 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  40.49 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  44.9 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  40.12 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  44.65 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  43.83 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  42.35 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  41.67 
 
 		 162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  42.77 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  46.75 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  43.23 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  43.83 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  42.48 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  41.18 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  40.13 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  40.13 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  41.21 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  42.24 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  37.42 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  43.21 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  43.51 
 
 		 154 aa  110  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  41.18 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  38.61 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  43.62 
 
 		 178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.33 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.33 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  40.14 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  41.18 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  39.44 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  39.44 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  39.44 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  38.67 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  39.44 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  39.44 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  38.67 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  42.94 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  38.36 
 
 		 167 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  39.44 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  42.31 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  41.36 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  41.18 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  39.44 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>