More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2628 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  100 
 
 
178 aa  354  2.9999999999999997e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  71.6 
 
 
169 aa  239  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  62.5 
 
 
168 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  64.07 
 
 
168 aa  218  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  64.07 
 
 
168 aa  217  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  62.57 
 
 
168 aa  217  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  68.26 
 
 
178 aa  217  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  63.47 
 
 
168 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  62.57 
 
 
168 aa  215  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  65.27 
 
 
168 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  66.05 
 
 
177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  62.28 
 
 
168 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  62.64 
 
 
172 aa  214  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  64.67 
 
 
167 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  62.28 
 
 
168 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  62.28 
 
 
168 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  62.28 
 
 
168 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  63.03 
 
 
167 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2085  peptide deformylase  59.88 
 
 
171 aa  206  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.444922  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  59.39 
 
 
169 aa  204  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  61.11 
 
 
167 aa  204  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  59.28 
 
 
169 aa  202  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  58.68 
 
 
170 aa  201  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  57.31 
 
 
170 aa  201  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  57.31 
 
 
170 aa  201  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  57.31 
 
 
170 aa  201  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  55.62 
 
 
178 aa  201  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  58.18 
 
 
169 aa  200  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  61.54 
 
 
177 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  59.28 
 
 
167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0017  peptide deformylase  57.93 
 
 
181 aa  197  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.746118  normal  0.214252 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  57.49 
 
 
170 aa  197  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  58.18 
 
 
169 aa  197  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  59.76 
 
 
169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4051  peptide deformylase  60.12 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3396  peptide deformylase  60.12 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  57.58 
 
 
169 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  57.58 
 
 
169 aa  194  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  56.29 
 
 
170 aa  194  7e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  56.97 
 
 
169 aa  193  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  56.97 
 
 
169 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  56.97 
 
 
169 aa  193  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  56.97 
 
 
169 aa  193  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  56.97 
 
 
169 aa  193  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  56.97 
 
 
169 aa  193  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  60.84 
 
 
170 aa  193  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  56.97 
 
 
169 aa  193  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  56.97 
 
 
169 aa  193  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  56.97 
 
 
169 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  56.97 
 
 
169 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  56.97 
 
 
169 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  56.97 
 
 
169 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  56.97 
 
 
169 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0035  peptide deformylase  53.33 
 
 
170 aa  191  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0880297 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  57.83 
 
 
179 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  56.36 
 
 
169 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  57.83 
 
 
179 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  57.83 
 
 
179 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  57.83 
 
 
167 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  55.95 
 
 
167 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  55.76 
 
 
172 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  55.76 
 
 
172 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  57.4 
 
 
171 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4082  peptide deformylase  58.82 
 
 
170 aa  188  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.364663  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0038  peptide deformylase  52.38 
 
 
169 aa  188  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.346284 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  57.49 
 
 
168 aa  187  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  56.47 
 
 
167 aa  187  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  59.39 
 
 
170 aa  187  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  59.39 
 
 
170 aa  187  7e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  56.02 
 
 
177 aa  187  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  56.02 
 
 
177 aa  187  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  56.02 
 
 
170 aa  187  9e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  57.23 
 
 
167 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  57.23 
 
 
167 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  57.23 
 
 
179 aa  186  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  57.67 
 
 
185 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  52.91 
 
 
193 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  55.49 
 
 
174 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  57.23 
 
 
216 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  53.66 
 
 
167 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  53.01 
 
 
168 aa  185  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  56.02 
 
 
167 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  55.42 
 
 
181 aa  185  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  53.66 
 
 
167 aa  185  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  56.02 
 
 
167 aa  185  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0070  peptide deformylase  58.54 
 
 
169 aa  184  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3065  peptide deformylase  56.02 
 
 
167 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  54.22 
 
 
168 aa  184  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  54.22 
 
 
168 aa  184  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  54.22 
 
 
168 aa  184  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  55.15 
 
 
169 aa  184  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  57.06 
 
 
185 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3878  peptide deformylase  58.9 
 
 
173 aa  184  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3736  peptide deformylase  51.52 
 
 
170 aa  184  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186056 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0031  peptide deformylase  53.33 
 
 
199 aa  184  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  56.44 
 
 
185 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  57.06 
 
 
185 aa  183  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  54.88 
 
 
167 aa  183  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  56.29 
 
 
167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  56.29 
 
 
167 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>