More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5601 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  65.92 
 
 		 213 aa  226  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  62.5 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  62.26 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  57.14 
 
 		 221 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  57.4 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  59.17 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  53.45 
 
 		 230 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  52.1 
 
 		 199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  50.29 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  53.89 
 
 		 225 aa  165  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  57.05 
 
 		 195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  48.89 
 
 		 192 aa  158  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  51.45 
 
 		 219 aa  157  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  50.94 
 
 		 190 aa  151  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  52.44 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  49.39 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  49.08 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  51.53 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  50.61 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  52.12 
 
 		 162 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  50.31 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  52.12 
 
 		 200 aa  141  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  47.56 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  47.4 
 
 		 227 aa  140  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  49.69 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  49.69 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  49.69 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  45.51 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  51.46 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  50.62 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  52.1 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  51.23 
 
 		 198 aa  137  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  46.39 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  49.07 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  43.86 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  47.27 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  44.07 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  45.78 
 
 		 183 aa  134  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  47.8 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  47.85 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  39.53 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  39.53 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  48.15 
 
 		 167 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  46.54 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  45.96 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  46.95 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  46.63 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  45.22 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  47.02 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  53.29 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  43.04 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  44.85 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  46.34 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  41.04 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  39.53 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  40.46 
 
 		 171 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  44.65 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  43.9 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  40.12 
 
 		 178 aa  121  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.29 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.29 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  43.06 
 
 		 230 aa  121  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  45.96 
 
 		 204 aa  121  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  46.75 
 
 		 182 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  45.51 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  41.72 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  41.04 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0647  peptide deformylase  40.57 
 
 		 173 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.895591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  39.75 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  40.46 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  39.88 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  37.8 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  39.87 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  40.49 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  39.76 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  38.46 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  40.49 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  41.89 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  41.89 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  41.89 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  39.24 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  41.88 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  44.59 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0872  peptide deformylase  39.53 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2532  peptide deformylase  39.53 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0298154  normal  0.981037 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  37.2 
 
 		 201 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  37.65 
 
 		 192 aa  114  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1867  peptide deformylase  39.02 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.743166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.04 
 
 		 168 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4045  peptide deformylase  43.93 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  39.74 
 
 		 168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5431  peptide deformylase  41.67 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  37.67 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  41.22 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  36.59 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  43.9 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  41.22 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  38.32 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  41.22 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>