More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5021 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  63.21 
 
 
221 aa  259  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  61 
 
 
230 aa  251  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  60.1 
 
 
219 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  59.78 
 
 
213 aa  208  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  52.36 
 
 
227 aa  186  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  59.21 
 
 
183 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  56.05 
 
 
173 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  53.89 
 
 
182 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  49.41 
 
 
190 aa  161  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  53.05 
 
 
185 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  53.85 
 
 
200 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  55.83 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  49.68 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  46.63 
 
 
199 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  45.51 
 
 
192 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  46.25 
 
 
181 aa  134  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  45.73 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  46.67 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  43.29 
 
 
181 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  43.9 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  41.15 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  47.17 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  45.73 
 
 
182 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  45.45 
 
 
182 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  47.06 
 
 
190 aa  125  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  43.64 
 
 
162 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  46.63 
 
 
168 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  45.78 
 
 
162 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  48.45 
 
 
200 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  43.02 
 
 
190 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  42.68 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  42.37 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  45.12 
 
 
197 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  44.17 
 
 
167 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  47.13 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  46.58 
 
 
188 aa  116  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  43.9 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  42.41 
 
 
184 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  43.98 
 
 
164 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  42.14 
 
 
188 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  51.54 
 
 
191 aa  114  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  41.24 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  41.98 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  39.51 
 
 
162 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  42.77 
 
 
161 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  40.12 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  39.63 
 
 
164 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  43.21 
 
 
162 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  44.51 
 
 
181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  42.07 
 
 
180 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  40.49 
 
 
162 aa  112  6e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  40.12 
 
 
183 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  46.43 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  40.11 
 
 
197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  40.11 
 
 
197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  41.36 
 
 
186 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  40.11 
 
 
197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  41.09 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  40.76 
 
 
166 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  40.25 
 
 
162 aa  108  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  39.74 
 
 
170 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  39.74 
 
 
170 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  40.71 
 
 
185 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  37.64 
 
 
209 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  37.8 
 
 
162 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  43.8 
 
 
173 aa  105  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  33.33 
 
 
187 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  36.31 
 
 
169 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  40.56 
 
 
147 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.13 
 
 
154 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  40 
 
 
185 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0097  peptide deformylase  37.78 
 
 
192 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  40.76 
 
 
150 aa  102  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  43.07 
 
 
178 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  40.13 
 
 
169 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2132  formylmethionine deformylase  40.25 
 
 
204 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.8462e-16  decreased coverage  0.0000656702 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  40.56 
 
 
147 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  38.71 
 
 
167 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  40.13 
 
 
169 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  41.25 
 
 
177 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  40.13 
 
 
169 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  40.13 
 
 
169 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  40.13 
 
 
169 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  39.47 
 
 
169 aa  102  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  39.29 
 
 
185 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1330  peptide deformylase  38.42 
 
 
178 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.290852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  40.13 
 
 
169 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  41.25 
 
 
177 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  39.73 
 
 
171 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  39.47 
 
 
169 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  39.47 
 
 
169 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  39.47 
 
 
169 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  39.47 
 
 
169 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  39.47 
 
 
169 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  39.47 
 
 
169 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  39.47 
 
 
169 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  39.47 
 
 
169 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  38.67 
 
 
192 aa  101  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  38.89 
 
 
177 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>