More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0768 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  85.95 
 
 
185 aa  322  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  84.86 
 
 
185 aa  318  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  84.86 
 
 
185 aa  316  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  56.44 
 
 
178 aa  184  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  55.21 
 
 
167 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  54.49 
 
 
167 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  55.35 
 
 
169 aa  177  9e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  57.5 
 
 
177 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  54.32 
 
 
169 aa  174  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  55.49 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  55.7 
 
 
167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  52.73 
 
 
168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  53.55 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  50.52 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  55.97 
 
 
167 aa  171  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  55.97 
 
 
167 aa  171  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  51.79 
 
 
168 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0193  peptide deformylase  50 
 
 
169 aa  169  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  53.09 
 
 
170 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0615  peptide deformylase  53.09 
 
 
170 aa  170  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00752277  normal  0.0138093 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  53.29 
 
 
169 aa  170  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  53.09 
 
 
170 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  52.69 
 
 
169 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  52.69 
 
 
169 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  52.69 
 
 
169 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  52.69 
 
 
169 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  52.69 
 
 
169 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  52.69 
 
 
169 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  52.69 
 
 
169 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  52.69 
 
 
169 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  51.15 
 
 
178 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  51.5 
 
 
170 aa  168  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  51.5 
 
 
170 aa  168  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  53.09 
 
 
169 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  53.09 
 
 
169 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  53.09 
 
 
169 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  53.09 
 
 
169 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  53.09 
 
 
169 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  52.1 
 
 
169 aa  167  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  51.52 
 
 
168 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  52.1 
 
 
169 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  47.65 
 
 
187 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0195  peptide deformylase  56.97 
 
 
178 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  49.08 
 
 
171 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  47.65 
 
 
187 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  50.91 
 
 
168 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  55.95 
 
 
173 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0043  peptide deformylase  51.48 
 
 
167 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  52.47 
 
 
168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  55.06 
 
 
167 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0818  peptide deformylase  47.95 
 
 
171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  51.52 
 
 
170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0128  peptide deformylase  53.42 
 
 
179 aa  165  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  52.47 
 
 
168 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  49.4 
 
 
168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  51.19 
 
 
169 aa  164  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  50.91 
 
 
168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  50.3 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  49.69 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4416  peptide deformylase  53.12 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  54.78 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0346  peptide deformylase  52.8 
 
 
167 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0150  polypeptide deformylase  52.8 
 
 
179 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0159  polypeptide deformylase  52.8 
 
 
179 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  47.02 
 
 
171 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  48.82 
 
 
174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  48.21 
 
 
175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0129  polypeptide deformylase  52.76 
 
 
182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  50.91 
 
 
168 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  50.91 
 
 
168 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  50.3 
 
 
170 aa  161  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  50.31 
 
 
169 aa  161  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0416  peptide deformylase  48.43 
 
 
167 aa  160  7e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0309  peptide deformylase  52.5 
 
 
167 aa  160  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  48.21 
 
 
171 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0261  peptide deformylase  54.9 
 
 
173 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.632283 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  50.92 
 
 
172 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2513  peptide deformylase  52.8 
 
 
167 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.449924  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3124  peptide deformylase  50.93 
 
 
181 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187097 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3127  peptide deformylase  52.8 
 
 
167 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0886547  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2352  polypeptide deformylase  52.17 
 
 
179 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2274  peptide deformylase  52.17 
 
 
216 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  49.4 
 
 
168 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  51.88 
 
 
168 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0142  peptide deformylase  52.17 
 
 
167 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.394236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2806  peptide deformylase  52.17 
 
 
167 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0035  peptide deformylase  53.75 
 
 
167 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  50.31 
 
 
172 aa  158  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  45.66 
 
 
174 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  47.62 
 
 
172 aa  158  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0634  peptide deformylase  53.09 
 
 
172 aa  158  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00220243  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3143  peptide deformylase  52.17 
 
 
167 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0648  peptide deformylase  53.09 
 
 
172 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.69456e-25 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6478  peptide deformylase  52.8 
 
 
167 aa  157  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755345 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  48.48 
 
 
170 aa  157  9e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3356  peptide deformylase  53.46 
 
 
171 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.253244  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3679  peptide deformylase  53.46 
 
 
171 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00022  peptide deformylase  47.83 
 
 
169 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3182  peptide deformylase  52.17 
 
 
167 aa  156  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>