More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10434 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  85.28 
 
 		 197 aa  347  9e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  82.23 
 
 		 197 aa  334  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  81.73 
 
 		 197 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  81.73 
 
 		 197 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  81.73 
 
 		 197 aa  319  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  69.54 
 
 		 198 aa  276  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  68.18 
 
 		 200 aa  261  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  65.64 
 
 		 195 aa  258  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  65.96 
 
 		 183 aa  251  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  60.91 
 
 		 190 aa  249  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  55.33 
 
 		 190 aa  214  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  56.85 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  54.19 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  50.49 
 
 		 215 aa  181  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  45.18 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  52.12 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  45.81 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  44.13 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  51.53 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  48.96 
 
 		 188 aa  142  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  48.28 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  48.02 
 
 		 167 aa  138  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  52.76 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  46.11 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  45.36 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  51.98 
 
 		 178 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  44.69 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  51.61 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  41.84 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  50 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  47.43 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  45.51 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  45.71 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  45.51 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  48 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  44.63 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  40.59 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  41.9 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  42.58 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  39.77 
 
 		 163 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  45.88 
 
 		 227 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  44.63 
 
 		 162 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  43.24 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  42.94 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  41.24 
 
 		 162 aa  124  9e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  39.6 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  42.94 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  43.58 
 
 		 180 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  43.58 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  40.88 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  45.12 
 
 		 225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  39.11 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  41.38 
 
 		 164 aa  118  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  42.16 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  40.78 
 
 		 181 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  43.33 
 
 		 185 aa  116  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  38.59 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2602  peptide deformylase  45.12 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.280121  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  43.79 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  38.55 
 
 		 166 aa  111  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  41.9 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  40.49 
 
 		 154 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  41.1 
 
 		 162 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2233  peptide deformylase  40.91 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1371  peptide deformylase  41.88 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  38.51 
 
 		 150 aa  101  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  36.46 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  36.46 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  41.42 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  38.69 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  38.76 
 
 		 168 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  33.52 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0049  peptide deformylase  37.87 
 
 		 178 aa  99  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  36.11 
 
 		 171 aa  99  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  38.36 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  38.89 
 
 		 167 aa  98.6  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2292  peptide deformylase  38.33 
 
 		 216 aa  99  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  38.2 
 
 		 168 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00200  peptide deformylase  37.64 
 
 		 168 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0942846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  39.51 
 
 		 170 aa  97.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  39.51 
 
 		 170 aa  97.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0020  peptide deformylase  37.64 
 
 		 168 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.139599  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  39.51 
 
 		 167 aa  97.8  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  35.06 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  36.69 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  39.51 
 
 		 167 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  36.69 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  35.96 
 
 		 168 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  39.66 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  38.2 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  35.33 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  34.27 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  36.61 
 
 		 168 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  39.51 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  43.45 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  41.82 
 
 		 173 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  38.2 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  41.1 
 
 		 159 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  38.14 
 
 		 177 aa  95.5  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>