More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3853 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  100 
 
 		 150 aa  296  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  63.33 
 
 		 152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  62 
 
 		 164 aa  194  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  62.24 
 
 		 155 aa  182  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  60.69 
 
 		 154 aa  174  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  55.78 
 
 		 152 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  59.06 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  61.54 
 
 		 170 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  58.04 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  59.72 
 
 		 166 aa  153  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  54.55 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  52.98 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  52.05 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  54.79 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  52.67 
 
 		 167 aa  148  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00391  peptide deformylase  48.37 
 
 		 172 aa  147  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0075  peptide deformylase  47.71 
 
 		 169 aa  145  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002057  peptide deformylase  47.71 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.424393  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  49.35 
 
 		 178 aa  143  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3014  peptide deformylase  48.37 
 
 		 167 aa  142  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  51.39 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0142  peptide deformylase  50.63 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00942793  normal  0.794986 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  48.37 
 
 		 178 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  48.97 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  50 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  48.03 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  50 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  50 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  49.66 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2473  peptide deformylase  46.71 
 
 		 169 aa  140  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  49.32 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  49.32 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  49.32 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  49.32 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  49.32 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  50.34 
 
 		 170 aa  139  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  50.34 
 
 		 170 aa  139  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  49.32 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3338  peptide deformylase  50.34 
 
 		 167 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  49.02 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0394  peptide deformylase  49.66 
 
 		 191 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  46.45 
 
 		 174 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0020  peptide deformylase  46.98 
 
 		 167 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.133709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  46.45 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0019  polypeptide deformylase  46.98 
 
 		 167 aa  135  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  47.92 
 
 		 147 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0043  peptide deformylase  43.14 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.598782  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0078  peptide deformylase  46.21 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.97939 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  48.03 
 
 		 177 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  47.92 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  48.98 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1929  peptide deformylase  44.52 
 
 		 170 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0496  peptide deformylase  42.68 
 
 		 193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  47.59 
 
 		 169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0356  peptide deformylase  45.75 
 
 		 169 aa  133  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  48.97 
 
 		 167 aa  133  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  47.65 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3789  peptide deformylase  47.59 
 
 		 170 aa  133  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.156401  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1865  peptide deformylase  45.16 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3718  peptide deformylase  48.28 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.042334  decreased coverage  0.00215529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3582  peptide deformylase  47.59 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0619898  normal  0.143654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  48.03 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  48.03 
 
 		 185 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  44.67 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  46.75 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  43.24 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1604  polypeptide deformylase  48.32 
 
 		 155 aa  131  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000418701  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  47.62 
 
 		 158 aa  131  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4511  peptide deformylase  45.1 
 
 		 169 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00434578  hitchhiker  0.000144884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  45.21 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3968  peptide deformylase  46.9 
 
 		 170 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3671  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.703673  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0040  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  130  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  43.23 
 
 		 171 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3585  peptide deformylase  45.81 
 
 		 170 aa  130  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03137  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.347821  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0427  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3773  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03088  hypothetical protein  46.9 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3769  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00722898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3710  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399963  normal  0.124168 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0427  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  hitchhiker  0.00115493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3480  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000466805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4609  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000863065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3675  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3603  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.53295 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4688  peptide deformylase  46.41 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3602  peptide deformylase  46.9 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0167703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  47.37 
 
 		 185 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0439  peptide deformylase  44.44 
 
 		 170 aa  130  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.401937  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1885  polypeptide deformylase  47.65 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.366875  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  42.58 
 
 		 190 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5113  peptide deformylase  50.68 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0220791  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  43.87 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0029  peptide deformylase  43.45 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.948652  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0027  peptide deformylase  43.45 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0035  peptide deformylase  43.45 
 
 		 168 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0316  peptide deformylase  45.1 
 
 		 170 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0032  peptide deformylase  42.76 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3882  peptide deformylase  45.1 
 
 		 170 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000140056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>